香蕉磷脂酶C基因生物信息学及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 殷菲胧

作者： 殷菲胧;廖玲燕;刘云芬;孙健;郑培君;李丽;帅良

作者机构：

关键词： 香蕉;磷脂酶C;生物信息学;基因表达

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2024 年 22 卷 022 期

页码： 7309-7318

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探究香蕉磷脂酶C (phospholipase C, PLC)基因的功能，本研究通过blastp结合结构域筛选的方法，从香蕉基因组搜索鉴定出5个磷脂酶C基因，分别命名为MaPI-PLC2、MaPI-PLC6、MaNPC1、MaNPC2和MaNPC6，并对其进行了生物信息学和组织特异性表达分析。生物信息学分析表明，5个香蕉PLC蛋白氨基酸数在515～593之间，等电点在5.72～8.96之间；5个香蕉PLC蛋白均为不稳定的亲水性蛋白；跨膜结构分析发现，只有MaNPC1有跨膜结构，其他4个香蕉PLC蛋白均无跨膜结构；信号肽预测发现，所有的MaNPC均有信号肽，所有的MaPI-PLC均无信号肽。香蕉果实PLC基因不同组织特异性表达分析结果显示，MaPI-PLC-2、MaNPC-2和MaPI-PLC-6基因均在芽、嫩叶和根中有较高表达，MaNPC6在未成熟的果皮和果肉中高度表达，MaNPC1则在成熟的组织(果皮,果肉,老叶)表达含量远高于未成熟组织(果皮,果肉,芽,嫩叶)，表明香蕉磷脂酶C全程参与了香蕉发育、成熟和衰老。本研究可为后期香蕉磷脂酶C功能研究奠定基础。

分类号： S668.1

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