不同禾本科作物中ZmWRKY79同源基因的鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 卢源达

作者： 卢源达;陈玲;杜云龙;刘学思;柯学;赵建屛;吴洪钦;刘鑫;李玉琢;朱文强;邢世军;程在全;钟巧芳

作者机构：

关键词： 玉米;ZmWRKY79;同源基因;生物信息学

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2023 年 003 期

页码： 522-531

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】玉米ZmWRKY79基因在合成植保素和干旱胁迫响应中发挥重要作用。文章旨在通过生物信息学技术从不同禾本科作物中挖掘更多的ZmWRKY79同源基因，为玉米及其它禾本科作物提供抗逆境胁迫的候选基因。【方法】从NCBI数据库中获取玉米ZmWRKY79同源基因的基本信息，并对其进行染色体定位、基因结构可视化、功能结构域预测、进化关系分析、亚细胞定位预测、启动子顺式作用元件预测及非生物胁迫表达预测。【结果】在玉米、谷子、高粱、青稞、野生二粒小麦、普通小麦、水稻作物中共鉴定到9个ZmWRKY79同源基因，这些基因结构相似性较高，分布于不同的染色体上，且均属于第III类WRKY转录因子。系统进化分析结果显示ZmWRKY79蛋白同源序列可被分为I和II类，不同成员间进化受纯化选择，其中ZmWRKY79蛋白与高粱SbWRKY54蛋白同源性较高，达到81.58%。亚细胞定位预测显示所有ZmWRKY79同源蛋白均在细胞核，说明ZmWRKY79同源基因均在细胞核中发挥功能。启动子顺式作用元件预测显示ZmWRKY79同源基因的启动中主要包含组织特异性元件、应激响应元件和激素响应元件。非生物胁迫表达预测表明，ZmWRKY53和ZmWRKY74 2个ZmWRKY79的同源基因被确定为受逆境胁迫诱导。【结论】在7种禾本科作物中鉴定到9个ZmWRKY79同源基因，这些同源基因可能具有抗逆功能，为禾本科作物抗逆研究提供了更多的基因选择。

分类号： S51

  • 相关文献

[1]不同植物Mlo基因全基因组鉴定及系统进化分析. 史建磊,万红建,熊自立,张海利,马彦如,苏世闻,宰文珊. 2020

[2]蒺藜苜蓿花器官特异基因的表达分析. 马利超,王彦荣,刘志鹏. 2012

[3]水稻Pi9位点6个稻瘟病抗性基因特异分子标记的开发及应用. 杨好,黄衍焱,易春霖,石军,谭楮湉,任文芮,王文明. 2023

[4]葡萄成花分子生物学研究进展. 丰景,卢江. 2018

[5]樱桃番茄Cf9基因调控元件预测及同源基因系统发育分析. 刘子记,刘维侠,牛玉,杨衍. 2020

[6]大豆百粒重相关基因的全基因组发掘分析. 宿洋,杨静,郭勇,杜维俊,邱丽娟. 2021

[7]绵羊脑多头蚴病45m基因在多头绦虫和细粒棘球绦虫不同发育阶段同源性的比较. 由弘,张壮志,赵莉,石保新,吐尔洪·依米提,王进成,张文宝,崔德胜,艾尔肯,郭金梁. 2009

[8]雄蕊瓣化形成机制研究进展. 欧景莉,黄雪梅,胡艺帆,韦壮敏,杨贵兵,陈豪军,何江,马松琼,范競升,彭东海. 2023

[9]甘蓝型油菜每角果粒数全基因组关联分析. 肖小军,陈明,韩德鹏,余跑兰,郑伟,肖国滨,周庆红,周会汶. 2023

[10]番茄Mi-1基因调控元件及同源基因进化分析. 刘子记,刘维侠,牛玉,杨衍. 2020

[11]我国羊泰勒虫病快速诊断方法成环恒温扩增法的研制. 刘志杰,侯俊玲,MohammedA.Bakheit,DiaeldinA.salih,罗建勋,殷宏,JabbarS.Ahmed,UlrikeSeitzer. 2009

[12]镉污染土壤中甘薯镉元素的时空积累规律. 张道微,董芳,张亚,黄艳岚,张超凡. 2020

[13]樱桃番茄Ph-3基因调控元件与同源基因系统进化分析. 刘子记,刘维侠,牛玉,杨衍. 2020

[14]基于甘蔗AP85-441和R570基因组参考序列的微卫星位点鉴定和SSR标记开发. 徐志军,赵胜,胡小文,孔冉,苏俊波,刘洋. 2020

[15]西番莲HSF基因家族的全基因组鉴定及成花期对高温胁迫的响应. 吴艳艳,刘洁云,周俊妞,田青兰,黄伟华,朱陈利,牟海飞. 2025

[16]玉米FLA蛋白家族的生物信息学分析. 胡颖,陈亚波,宋群星. 2017

[17]玉米ZmCPB1基因的克隆、表达及生物信息学分析. 刘江,赵兴华,韩斌,王铭,路贵和,王长彪,李新征. 2021

[18]高温胁迫下不同玉米花粉组蛋白Zm-H3基因的克隆及表达分析. 徐劲松,杨海鹏,张红梅,刘小红,郝耀山,孙毅. 2021

[19]玉米ZmRab6A基因的克隆与生物信息学分析. 时丕彪,胡凤琴,顾小兵,吕远大. 2020

[20]玉米TCP家族基因生物信息学鉴定与分析. 王玉红,徐立华,李军. 2014

作者其他论文 更多>>

微信小程序