猪多潜能性维持因子5 cDNA全序列的克隆与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李勇

作者： 李勇;王立刚;王立贤;乔丽娟;张龙超;颜华

作者机构：

关键词： 猪;多潜能性维持因子5;序列克隆;生物信息学分析

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2010 年 18 卷 02 期

页码： 89-93

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用前期筛选出的一些与母猪妊娠相关的有价值的新候选基因,选取其中一个位于网络顶端的EST序列(CK455976),根据此EST序列设计引物,以母猪卵巢为材料提取总RNA,运用RT-PCR和RACE-PCR对其进行cDNA全序列克隆,得到多潜能性维持因子5(developmental pluripotency associated5,DPPA5)基因cDNA全长596bp,提交GenBank数据库,登录号为FJ436413。经序列分析发现,其中5'UTR长67bp,3'UTR长175bp,编码区长354bp,编码117个氨基酸。同源性比对分析发现,该基因核苷酸序列与人、小鼠、猕猴和狗的DPPA5基因同源性分别为83%、70%、83%和80%;编码的氨基酸序列同源性分别为74%、55%、74%和69%。经生物信息学分析,预测出DPPA5的相对分子量约13.60kD,等电点5.24,在约1～10、18～29、38～51、60～66和75～110位之间氨基酸存在亲水性区域,DPPA5蛋白主要存在于细胞膜外侧。

分类号： S828

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