猪星状病毒的流行病学调查及遗传进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李本强

作者： 李本强;陶洁;程靖华;石迎;乔长涛;刘惠莉

作者机构：

关键词： 猪星状病毒;混合感染;季节性;遗传进化分析;基因序列重组

期刊名称： 中国预防兽医学报

ISSN： 1008-0589

年卷期： 2021 年 010 期

页码： 1046-1050,1073

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解上海地区猪群中猪星状病毒（PAstV）的流行现状及其遗传特性,本研究于2016年～2020年间在上海不同地区10个猪场共采集了1 416份仔猪腹泻粪便样品,利用RT-PCR方法及生物信息学技术进行检测与分析。结果显示,PAstV的总阳性率为26.2%,PAstV与其他腹泻病病原的混合感染情况较复杂,二重感染率占比达56.93%,主要以PAstV/猪嵴病毒（PKoV）为主（20.07%）;三重感染率占比29.41%,以PAstV/PKoV/猪流行性腹泻病毒（PEDV）（10.09%）感染模式为主;四重感染率为11.4%,以PAstV/牛病毒性腹泻病毒（BVDV）/猪札幌病毒（PoSaV）/猪萨佩罗病毒（PSV）（13.51%）感染为主。猪群中PAstV的流行与气温差有很大关系,在季节交替时节流行率较高,特别是秋冬交替时节。选取其中2个PAstV阳性样品（JS-PAstV和CM-PAstV）进行全基因组序列的测定和分析,结果显示两者的全基因组同源性不高,仅为73.8%。全基因组进化分析显示,CM-PAstV分别与挪威、日本、美国的PAstV 3型的亲缘性较近;而JS-PAstV与匈牙利的PAstV 3型的亲缘性最近。对ORF2基因进行病毒重组分析,显示JS-PAstV和CM-PAstV的ORF2基因均与人星状病毒之间存在重组现象。提示,上海地区猪群中存在PAstV 3型的流行,且遗传距离较远,但存在与人星状病毒重组的风险,需进一步监测关注。本研究数据丰富了国内PAstV的流行病学资料,可为该病的风险防控提供科学数据。

分类号： S852.65

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