“沪农灵芝1号”聚酮合酶特异性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 龚明

作者： 龚明;鲍大鹏;唐传红;张劲松

作者机构：

关键词： 灵芝;比较基因组分析;次级代谢;PKS;通路富集分析

期刊名称： 食用菌学报

ISSN： 1005-9873

年卷期： 2017 年 04 期

页码： 1-5+99

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对"沪农灵芝1号"(简称沪灵芝)(Ganoderma lucidum SH)等10个代表性的担子菌物种进行全基因组次级代谢物(secondary metabolite,SM)簇分析,结果显示沪灵芝聚酮合酶(polyketide synthases,PKS)的骨架基因以及SM簇的数量分别为5和3,高于其它物种,并且都位于支架的末端。通过生物信息学分析发现,PKS7和9的SM簇只在沪灵芝中分布;只有PKS7的SM簇(PKS7簇)的骨架基因具有完整的I型PKS功能模块;只有PKS7簇的骨架基因具有单拷贝直系同源性;PKS7簇的功能注释基因在不饱和脂肪酸生物合成通路中富集。这些结果表明PKS7簇为沪灵芝特异性的SM簇,可能代表了沪灵芝抗逆性强的分子特征。

分类号： S567.31

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