畜禽长链非编码RNA的功能及其研究方法

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陆启荣

作者： 陆启荣;刘孟轲;李丽;程古月;郝海红;王旭;戴梦红;袁宗辉

作者机构：

关键词： 长链非编码RNA;畜禽;生物学功能;研究方法

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2016 年 09 期

页码： 2425-2434

收录情况： 北大核心

摘要： 长链非编码RNA(long noncoding RNA,LncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子,不具有编码蛋白质的能力,主要参与脂肪代谢、肌肉发育、胚胎发育、性别决定与分化等多种生物过程和疾病的调控。在LncRNA研究中,研究方法的建立和应用起着至关重要的作用。作者简述了LncRNA的生物学特性和生物学功能,重点介绍了LncRNA的主要研究方法:基因芯片、RNA-seq、Northern blotting、荧光原位杂交(FISH)、实时荧光定量PCR、RNA结构平行分析(PARS)、快速预测RNA和蛋白质相互作用(CatRAPID)等,同时介绍了LncRNA与DNA、RNA及蛋白质的相互作用的方法:RNA-pulldown、RNA结合蛋白免疫沉淀(RIP)、光活性增强的核糖核苷交联和免疫共沉淀(PAR-CLIP)、RNA反义纯化(RAP)、RNA纯化的染色质分离(CHIRP)及RNA靶标的捕获杂交分析(CHART)、交联,连接以及混合测序(CLASH),为畜禽动物中LncRNA的研究提供借鉴。

分类号： S852.2

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