绵羊Izumo1基因多态性及其与产羔数关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 胡文萍

作者： 胡文萍;董新龙;田志龙;汤继顺;刘秋月;王翔宇;狄冉;张效生;张金龙;王金玉;储明星

作者机构：

关键词： 绵羊;Izumo1基因;克隆;多态性;SNP;产羔数

期刊名称： 中国农业大学学报

ISSN： 1007-4333

年卷期： 2020 年 01 期

页码： 95-104

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究Izumo1基因多态性及与产羔数关系,本研究利用PCR和直接测序法对小尾寒羊和苏尼特羊的Izumo1基因DNA序列进行扩增、测序和BLAST分析,并和本课题组前期绵羊重测序数据进行比对,筛选出Izumo1基因SNP位点。同时,采用Sequenom MassARRAY~?技术进行基因分型,并对其SNP位点的基因型和等位基因频率在各群体中的分布进行研究。结果表明:小尾寒羊Izumo1基因DNA全长序列3 385 bp,苏尼特羊Izumo1基因DNA全长序列3 382 bp;筛选出8个Izumo1基因SNP位点,经过初步筛选,将在小尾寒羊、苏尼特羊、滩羊、萨福克羊、杜泊羊、草原藏羊这6个绵羊品种中位点分布没有差异的SNP位点排除,最终筛选获得的g.54412135A>G和g.54412107C>A 2个位点。Izumo1基因g.54412135A>G位点在多羔和单羔绵羊品种中存在GG、GA和AA 3种基因型,G基因为优势等位基因;g.54412107C>A在多羔品种中存在CC和CA 2种基因型,而在单羔品种中存在CC、CA和AA 3种基因型,C基因为优势等位基因,其基因型频率和基因频率在单、多羔绵羊群体间的分布差异均极显著(P<0.01);群体遗传学分析得出g.54412135A>G多态位点在6个品种中的多态信息含量(PIC)都属于低度多态(PIC<0.25);g.54412107C>A多态位点在杜泊羊中属于中度多态(0.25G和g.54412107C>A位点的不同基因型与小尾寒羊不同胎次产羔数之间不存在显著关联(P>0.05)。

分类号： S826

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