绵羊小卵泡与中卵泡转录组差异特征分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 吴阳升
作者: 吴阳升;林嘉鹏;汪立芹;陈莹;黄俊成
作者机构:
关键词: 绵羊;小卵泡;中卵泡;转录组;卵泡选择
期刊名称: 江苏农业学报
ISSN: 1000-4440
年卷期: 2016 年 32 卷 04 期
页码: 832-842
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 卵泡的选择和发育过程涉及到卵泡内多种基因表达的变化和调控。绵羊卵泡的选择和发育过程与卵泡直径变化密切相关。以绵羊健康小卵泡(1~2 mm)和中卵泡(3~4 mm)为材料,进行RNA测序,分析小卵泡发育至中卵泡过程转录组水平变化特征。在分子功能上显著变化的基因主要涉及酶活性的调节和离子结合;在细胞组分上显著变化的基因主要涉及细胞外基质和质膜蛋白;在生物学过程上显著变化的基因主要涉及细胞增殖的正调控、细胞通讯、免疫和刺激反应等过程。KEGG分析差异基因富集的通路主要是补体和凝血级联反应,吞噬小体,细胞因子-细胞因子受体相互作用,TGF-β信号通路和轴突导向等。从小卵泡到中卵泡表达上调的有脂代谢相关基因(APOA1、APOD、APOE),胰岛素样生长因子路径基因(IGFBP1、IGFBP7),肿瘤生长因子beta途径基因(INHBA),核心蛋白多糖基因(DCN),血管发生基因(MGP),跨膜4超家族成员1基因(TM4SF1),胞外基质重建基因(MMP1、MMP13),五聚素3基因(PTX3),金属蛋白酶组织抑制剂1基因(TIMP1)。从小卵泡到中卵泡表达下调的主要有转录因子C-FOS、EGR1、FOSB和线粒体编码的脱氢酶家族基因MT-ND1、MT-ND5、MT-ND6等。这些基因的表达变化表明绵羊卵泡的选择过程可能涉及到IGF和TGFb通路的抑制,脂代谢、血管生成的增强以及细胞增殖能力下降等生物过程。
分类号: S826
- 相关文献
[1]吉林梅花鹿非繁殖期卵泡动态变化. 陈秀敏,魏海军,赵伟刚,杨镒峰,宋兴超,宁浩然,薛海龙. 2012
[2]鸡卵泡选择及分子调控作用机制研究进展. 沈曼曼,马猛,卢建,王克华,李涛,吴萍,曲亮. 2023
[3]基于高通量测序的青花菜早期发育小孢子转录组分析与基因功能注释. 张振超,姚悦梅,毛忠良,孙国胜,秦文斌,戴忠良. 2018
[4]紫叶紫薇新品系叶色变化转录组分析. 王莹,李玉娟,李敏,马祥建,谈峰,郭聪,张健. 2018
[5]紫叶紫薇新品系叶色变化转录组分析. 王莹,李玉娟,李敏,马祥建,谈峰,郭聪,张健. 2018
[6]基于RNA-Seq技术的谷子新基因发掘及基因结构优化. 穆彩琴,张瑞娟,屈聪玲,韩渊怀,王兴春. 2016
[7]转录组测序(RNA-seq)策略及其数据在分子标记开发上的应用. 李小白,向林,罗洁,胡标林,田胜平,谢鸣,孙崇波. 2013
[8]黄瓜共表达基因模块的识别及其特点分析. 林行众,张忠华,杨清,黄三文. 2015
[9]海带转录组SSR序列特征及其相关基因功能分析. 李秋莹,张杰,姚建亭,王秀良,段德麟. 2016
[10]基于玛氏骨条藻转录组的脂肪酸合成途径分析. 张梅,米铁柱,甄毓,王华龙. 2018
[11]感染球孢白僵菌的家蚕免疫应答差异表达基因分析. 侯成香,覃光星,耿涛,高坤,潘中华,钱荷英,郭锡杰. 2014
[12]拟南芥不定芽发生早期的数字基因表达谱分析. 王兴春,杨致荣,张树伟,李红英,李生才. 2013
[13]基于RNA-Seq技术的鲮转录组分析. 许建,赵建,徐礼鸣,崔军,李强,朱新平,徐鹏. 2014
[14]基于新一代测序技术的昆虫转录组学研究进展. 张棋麟,袁明龙. 2013
[15]模拟干旱对甘薯近缘野生种[Ipomoea trifida(Kunth) G. Don]生理特性和基因表达谱的影响. 王娇,李雪华,戴习彬,成小威,孙健英. 2017
[16]马铃薯转录组EST-SSR挖掘及其多样性分析. 巩檑,程永芳,甘晓燕,陈虞超,聂峰杰. 2015
[17]基于RNA-seq数据的小麦条锈菌SSR标记开发. 刘秀峰,许静杨,袁文娅,梁丹,时晓伟. 2018
[18]基于玛氏骨条藻(Skeletonema marinoi)转录组的碳固定代谢途径分析. 刘乾,米铁柱,甄毓,王华龙,于志刚. 2016
[19]454测序技术开发微卫星标记的研究进展. 程晓凤,黄福江,刘明典,汪登强. 2011
[20]糙皮侧耳发酵玉米秸秆转录组揭示木质素降解相关途径. 马蕊,赵飞,范寰. 2017
作者其他论文 更多>>
-
峨边花牛生长曲线拟合及生长发育规律分析
作者:马晓琴;易军;方东辉;甘佳;阿果约达;石溢;邓小东;陈晓云;陈莹;付茂忠;李昭华;李永珍;邛莫吓儿;陈敏;王巍
关键词:峨边花牛;体尺;生长曲线拟合;生长发育规律
-
影响绵羊腹腔镜采卵效果因素的研究
作者:刘宽宽;陈莹;李杰;吴向利;古丽米热·阿布都热依木;徐新明;董红;黄俊成;林嘉鹏;汪立芹
关键词:腹腔镜采卵;卵母细胞;德国美利奴羊;中国美利奴羊
-
阿勒泰羊胚胎PDGFD基因编辑研究
作者:马秀玲;张欣如;陈莹;梁红艳;古丽米热·阿布都热依木;汪立芹;林嘉鹏;李伟健;王旭光;吴阳升
关键词:电转;CRISPR/Cas9;PDGFD;胚胎发育
-
四川肉牛产业发展报告
作者:阿果约达;王巍;甘佳;方东辉;陈晓云;陈莹;马晓琴;石溢;邓小东;易军;付茂忠
关键词:四川;肉牛产业;高质量发展;对策建议
-
雅安市肉牛产业发展现状与对策
作者:马晓琴;易军;王巍;方东辉;阿果约达;石溢;邓小东;陈晓云;陈莹;付茂忠;甘佳
关键词:雅安市;肉牛产业;合理布局;科学规划
-
不同剩余采食量对澳杜湖羊公羔屠宰性状、体组成和脂肪沉积的影响研究
作者:王博;哈尼克孜·吐拉甫;黄俊成;王许;林长春;董桂花;闫娜娜;李鹏飞;依明·苏来曼;吴伟伟
关键词:饲料效率;剩余采食量;屠宰性状;相关性;澳杜湖羊三元杂交F1代
-
枯草芽孢杆菌、植物乳杆菌和纤维素酶单独或联合添加对甜高粱青贮品质和微生物多样性的影响
作者:王子苑;王茜;吉玉玉;舒健虹;陈莹;陈才俊;王小利
关键词:甜高粱青贮;枯草芽孢杆菌;植物乳杆菌;纤维素酶;微生物多样性
