双盲口线虫ITS rDNA的PCR扩增及序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 刘梦婷
作者: 刘梦婷;李芬;靳元春;孙淼淼;刘国华
作者机构:
关键词: 双盲口线虫;内转录间隔区(ITS);PCR扩增;序列分析
期刊名称: 中国动物传染病学报
ISSN: 1674-6422
年卷期: 2018 年 05 期
页码: 53-57
收录情况: 北大核心
摘要: 以从波兰大西洋鳕体内采集的8条双盲口线虫样品为研究对象,利用保守引物通过PCR扩增其核糖体DNA内转录间隔区(internal transcribed spacers,ITS)ITS-1 rDNA、5.8S rDNA、ITS-2 rDNA后,将扩增片段纯化后克隆至pGEM-T Easy载体,经PCR及酶切鉴定后,对获得的阳性质粒DNA进行序列分析。结果显示,所获得的ITS rDNA及5.8S rDNA序列总长存在一定差异,ITS rDNA为885~927 bp,包含18S rDNA、28S rDNA部分序列及ITS-1 rDNA(441~449 bp)、5.8S rDNA(155 bp)和ITS-2rDNA(266 bp)全部序列。结果表明,双盲口线虫ITS序列种内相对保守(ITS-1 rDNA:0~2.2%;ITS-2 rDNA:0~3.4%),而种间差异较大(ITS-1 rDNA>20%;ITS-2 rDNA>35%),可作为种间遗传变异研究的标记。本研究结果为双盲口线虫的分子鉴定、种群遗传学以及双盲口线虫病的进一步研究提供了参考和依据。
分类号: S941.523
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