大麻GRAS转录因子家族的全基因组鉴定及镉胁迫下表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 尹明

作者： 尹明;杨大为;唐慧娟;潘根;李德芳;赵立宁;黄思齐

作者机构：

关键词： 大麻;GRAS转录因子;系统发育分析;基因结构分析;表达分析

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2021 年 006 期

页码： 1054-1069

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： GRAS转录因子在植物生长发育及抗逆境胁迫中具有重要作用。本文对大麻GRAS转录因子家族进行了全基因组鉴定,对其理化性质、系统进化发育、基因结构、基因间的共线性关系进行了分析,并利用云麻1号及内蒙古小粒大麻的转录组数据分析其在镉胁迫下的表达量变化。结果表明,大麻基因组中鉴定出54个GRAS基因, 96.30%的基因编码酸性蛋白,长度为415～757aa,分子质量为46,405.05～85,748.52kD,等电点为4.77～8.54,划分为9个亚家族,其中PAT1、LS、SHR、HAM保守性较高, PAT1、LISCL、CsGRASA出现大量基因串联重复, CSGRAS12基因在5种植物的共线性分析中均存在。将2个大麻品种进行镉胁迫处理发现,云麻1号株高下降10.48%,鲜重下降6.33%;内蒙古小粒大麻株高下降66.07%,鲜重下降42.67%,表明云麻1号较内蒙古小粒大麻更耐镉胁迫。云麻1号的54个GRAS基因中, 42个（77.78%）基因表达上调1.05～18.10, 11个（20.37%）基因表达下调0.13～0.91;内蒙古小粒大麻的54个GRAS基因中, 27个（50.00%）基因表达上调1.01～6.46, 27个（50.00%）基因表达下调0.30～0.96。将两者GRAS基因进行同源基因鉴定并分析其表达情况发现,耐镉品种云麻1号中40个同源GRAS基因较内蒙古小粒大麻在镉胁迫下的上调或下调幅度更明显,表明这些GRAS基因与镉胁迫有明显相关性。本文可为挖掘和验证大麻GRAS基因提供参考。

分类号： S563.3

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