香蕉穿孔线虫28S rRNA基因的D2/D3区序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李佳

作者： 彭德良;黄文坤

作者机构：

关键词： 香蕉穿孔线虫;28S rRNA基因;D2/D3扩展区域

期刊名称： 华中农业大学学报

ISSN： 1000-2421

年卷期： 2008 年 27 卷 05 期

页码： 19-23

收录情况： 北大核心

摘要： 采用线虫通用引物D2A和D3B对9个香蕉穿孔线虫种群的核糖体DNA28S大亚基的D2/D3区进行了扩增,获得的片段长度约为780bp,克隆测序后使用UPGMA法进行聚类分析和构建系统发育树。结果表明9个线虫种群D2/D3区核苷酸序列相似性为99.13%,其中8个群体的序列与越南报道的香蕉穿孔线虫近源种(Radopholus sp.7B VietNam)的D2/D3区核苷酸序列(DQ328712)相似性为97.46%,说明香蕉穿孔线虫D2/D3区具有较大的保守性。聚类分析结果表明,RSHN12r、RSSH、RSHL、RSHK、RSLZ、RSSZ、RSHN13、RSHN12p等8个种群聚为一类,亲缘关系很近,RSHN3群体与以上8个群体亲缘关系较远,说明RSHN12r、RSSH、RSHL、RSHK、RSLZ、RSSZ、RSHN13、RSHN12p这8个香蕉穿孔线虫种群可能来源于同一地理种群,而RSHN3种群可能来源于另一个地理种群。

分类号： S432.45

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