一株羊冠状病毒的分离鉴定及全基因组序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 余秋蓉

作者： 余秋蓉;蔡旭航;何艺;李基棕;毛立;许信刚;李彬

作者机构：

关键词： 羊冠状病毒;分离鉴定;全基因组测序;进化分析

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2025 年 56 卷 009 期

页码： 4604-4614

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 冠状病毒在全世界广泛流行,能够引起人和动物呼吸道和消化道疾病,动物感染冠状病毒对养殖业造成巨大经济损失.为进一步丰富我国草食动物冠状病毒的流行病学资料,笔者拟对新疆腹泻山羊样品进行羊冠状病毒(caprine coronavirus,cpCoV)分离研究,并开展生物学特性鉴定.用RT-PCR方法从新疆昌吉某羊场腹泻山羊肛拭子样品中检测到cpCoV阳性,成功分离一株羊冠状病毒,命名为cpCoV/XJCJ2301G.该毒株接种细胞后可观察到明显的细胞病变,IFA试验、RT-PCR检测均为cpCoV阳性,电镜观察可见直径100 nm,周围呈皇冠状的特异病毒颗粒.病毒的遗传演化结果表明,XJCJ2301G株处于β-CoVs Embecovirus分支,与现有羊冠状病毒共同组成独立进化分支,独立于牛冠状病毒的四个亚型.经分析NS4a-NS4b基因序列,发现在两段区域内有75 nt缺失突变,导致非结构蛋白截短或延长.S基因序列比对分析发现,cpCoV与BCoV的差异主要集中于CTD区域.本研究首次从新疆地区分离到的羊冠状病毒,丰富了我国冠状病毒的流行病学资料,其NS4a-NS4b碱基数量在牛、羊和兔冠状病毒之间形成阶梯式依次缺失,提示该毒株可能是动物冠状病毒演化过程中的节点,在草食动物冠状病毒的遗传演化过程中具有重要意义.

分类号： S852.659.6

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