奥利亚罗非鱼DMO蛋白结构和功能预测的研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 曹谨玲

作者： 曹谨玲;陈剑杰;吴婷婷

作者机构：

关键词： DMO;生物信息学;蛋白质结构;蛋白质功能;性别调控

期刊名称： 生物技术

ISSN： 1004-311X

年卷期： 2009 年 19 卷 01 期

页码： 13-16

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 目的:对奥利亚罗非鱼DMO蛋白的结构和功能进行预测研究。方法:利用生物信息学的方法对DMO基因推导的氨基酸序列进行结构特征和功能域预测分析,探讨了DMO的信号肽、亲/疏水性、跨膜拓扑结构、卷曲螺旋结构、基序、功能域及高级结构。结果:DMO在第1~17,39~113,153~301,372~410区段为高亲水性区域,属亲水性基团,具有两个螺旋卷曲区域,97~112,155~168氨基酸区域,没有信号肽,含有两个跨膜结构域,发生跨膜运动;DMO包含两个保守的DM-domain和DNA锌指结构等功能结构域;DMO含有1个亮氨酸拉链结构(21~42),7个蛋白激酶C磷酸化位点(49~51,184~186,191~193,235~237,270~272,294~296,333~335),5个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点(189~192,225~228,227~230,231~234,233~236),1个cAMP-andcGMP-依赖蛋白激酶磷酸化位点(296~299)10个肉豆蔻酰化位点(59~64,121~126,125~130,129~134,135~140,301~306,304~309,307~312,310~315,350~355);DMO蛋白含有27.38%的α-螺旋,8.8%的β-转角和53.79%的无规卷曲;DMO的高级结构中含有两个α-螺旋区域。结论:DMO蛋白与性别调控有关,并在细胞信号传导中发挥作用,且其生物活性可能接受信号途径中多种信号的调控,这为进一步研究奥利亚罗非鱼DMO基因编码蛋白的功能,明确DMO基因与性别调控的关系奠定了基础。

分类号： S917.4

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