大豆花叶病毒武汉分离物全基因测序及系统进化分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 邓克林

作者: 邓克林;卢自华;李艳娇;杨远霄;黎超;陈水莲;杨红丽;单志慧;郝青南;陈海峰

作者机构:

关键词: 大豆花叶病毒;武汉分离物;全基因测序;系统进化

期刊名称: 湖北农业科学

ISSN: 0439-8114

年卷期: 2025 年 64 卷 009 期

页码: 238-245

收录情况: 北大核心

摘要: 从武汉采集表现花叶症状的大豆叶片,通过RT-PCR检测和全基因组扩增,获得一株大豆花叶病毒(SMV),命名为SMV-WH。SMV-WH的基因组全长为9 940 nt,其编码多聚蛋白的开放阅读框位于111~9 719 nt。序列分析表明,SMV-WH与GenBank中164个SMV的全基因组核苷酸序列一致性在74.88%~98.36%,氨基酸序列一致性为75.15%~99.09%,表明SMV-WH具有较高的遗传多样性。系统进化分析显示,SMV-WH与来自中国的分离株LJZ010、LJZ002、DSMZ PV-0841、DSMZ PV-0938、JSJJ00和SCSN及来自韩国的分离株Anseong聚为一簇,与Anseong和SCSN亲缘关系最近。蛋白1(P1)中E299K的突变改变了蛋白激酶C磷酸化位点,而辅助组分蛋白酶(HC-Pro)中G593S的突变改变了酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点。三维结构预测表明这些突变引起了蛋白构象的变化。

分类号: S435.651

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