玉米SEs基因家族生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴立仁

作者： 吴立仁;张冬雪;唐贵;隋冬华;武新娟;高佳缘;王腾;王璐瑶

作者机构：

关键词： 玉米;鲨烯环氧酶;生物信息学

期刊名称： 黑龙江农业科学

ISSN： 1002-2767

年卷期： 2022 年 007 期

页码： 14-19

摘要： 为获悉玉米SEs基因家族的功能和系统进化关系，利用生物信息学方法对玉米SEs基因家族进行鉴定，同时分析其家族成员理化性质、蛋白质二级结构、进化关系、基因结构、保守结构、氨基酸序列、染色体及启动子顺式作用元件。结果表明，在玉米中共鉴定到10个SEs基因家族成员，编码蛋白质的氨基酸序列长度为320～534 aa,分子量大小为33.85～56.94 kDa,等电点为6.57～9.15;亚细胞定位预测结果表明大部分玉米SEs蛋白定位在细胞质和原生质；系统进化树将玉米SEs基因家族分为3支；基因结构的保守基序分析说明玉米SEs基因家族存在一定的差异性；10个玉米SEs基因家族成员主要分布在Chr1、Chr5和Chr9上；氨基酸多序列比对分析表明10个玉米SEs基因家族成员存在一定的结构相似性；蛋白序列中存在10种Motif;启动子顺式作用元件分析表明玉米SEs基因主要受光响应、茉莉酸信号响应调控。

分类号： S513

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