油棕TCP转录因子家族生物信息学鉴定及基因表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 周丽霞

作者： 周丽霞;赵志浩;杨蒙迪;曹红星;杨耀东

作者机构：

关键词： 油棕;TCP转录因子;全基因组鉴定;表达分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2022 年 20 卷 017 期

页码： 5637-5648

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： TCP基因作为植物所特有的转录因子家族,广泛参与调控植物的生长发育、代谢、信号转导、生理生化刺激响应及逆境应答等多个生物学过程.本研究利用生物信息学研究方法鉴定获得28个油棕TCP基因家族成员,并对其染色体定位、结构特点、motif、聚类分析及组织表达特异性进行分析.结果表明:共有27个基因在油棕的14条染色体上呈不均匀分布;EgTCP基因的长度均相对较短,其中14个基因只有1个外显子,EgTCP11基因含外显子个数最多(5个);序列分析表明油棕TCP基因均含有高度保守的bHLH结构域,启动子上存在较多的植物激素响应及逆境应答等顺式作用元件;系统进化分析显示28个油棕TCP蛋白被划分为Class Ⅰ(13个蛋白)和Class Ⅱ(15个蛋白)两大类,其中Class Ⅱ进一步分为CYC/TB1(4个蛋白)和CIN(11个蛋白)两个亚类;通过表达模式分析发现花中特异表达的TCP基因数量最多(EgTCP05,EgTCP09,EgTCP15,EgTCP27和EgTCP28),EgTCP27基因在中果皮中的表达量逐渐上调,到花后23周时表达量升至最大.本研究为进一步探索油棕TCP基因的生物调控功能提供一定的理论基础.

分类号： S565.9

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