牛Dmrt7基因的cDNA克隆及遗传变异

文献类型： 中文期刊

第一作者： 淮亚红

作者： 淮亚红;许尚忠

作者机构：

关键词： Dmrt7基因;遗传变异;牛;SNP

期刊名称： 安徽农业科学

ISSN： 0517-6611

年卷期： 2009 年 37 卷 30 期

页码： 14607-14610+14615

收录情况： 北大核心

摘要： [目的]探讨牛Dmrt7基因的生物学功能及群体遗传变异情况,为进一步研究该基因对牛精液品质的影响奠定基础。[方法]以牛睾丸组织为材料,根据GenBank上发表的小鼠的Dmrt7基因序列设计并合成2对引物,通过RT-PCR分别进行了扩增并运用DNA-MAN软件及在线工具对所得到的序列进行了生物信息学分析;同时,以牛肾脏、肝脏、睾丸、肺、脾脏、瘤胃、子宫、小肠、心脏、卵巢和肌肉共11个组织为材料,另外设计2对引物用于组织表达谱分析。利用PCR-SSCP技术和DNA测序对Dmrt7基因的多态性进行检测。[结果]获得了一个长为1616bp的cDNA片段(GenBank登录号为EF534775),该cDNA包含由1113个碱基组成的开放读码框(ORF),该ORF编码370个氨基酸;发现在第四内含子上有一个C/G突变,随后在277头本地牛品种和国外牛品种中进行群体多态性检测,发现G等位基因频率分布范围从0～0.4138;基因杂合度,有效等位基因数和多态信息含量分别为0～0.4851、1.0000～1.9423和0～0.3675。[结论]克隆了牛Dmrt7基因的cDNA序列并进行组织表达谱分析,该G等位基因在本地牛品种和外国牛品种中没有差异。

分类号： S823`Q78

  • 相关文献

[1]牛Dmrt7基因cDNA的克隆和生物信息学分析. 淮亚红,许尚忠,姬爱国,王淑辉,高雪,陈金宝,任红艳. 2008

[2]斑玉蕈栽培菌株遗传变异与生长速率GWAS分析. 龚明,李燕,鲍大鹏,尚俊军,杨瑞恒,周陈力,万佳宁,吴莹莹. 2021

[3]牛DES基因的SNPs检测. 狄江,Cynthia DK Bottema,Bozena Kruk. 2004

[4]牛PGLYRP3、PGLYRP4基因多态性及其与SCS、产奶性状关联分析. 王洪亮,李志雄,刘小林,邢秀梅. 2015

[5]单核苷酸多态性标记在牛亲子鉴定中的应用与展望. 李东,初芹,王雅春. 2011

[6]钙蛋白酶3(CAPN3)基因多态性与牛胴体性状的关联分析. 侯冠彧,曾鸿普,王东劲,管松,黄显洲,许尚忠. 2010

[7]牛生长激素受体基因遗传变异研究. 高雪,许尚忠,张英汉. 2005

[8]牛类胰岛素生长因子IGF-Ⅰ基因研究. 高雪,许尚忠,任红艳,张英汉,陈金宝. 2006

[9]牛类胰岛素生长因子IGF-I基因研究. 高雪,许尚忠,任红艳,张英汉,陈金宝. 2006

[10]牦牛和犏牛Dmrt7基因序列分析及其在睾丸组织中的表达水平. 金帅,郭宪,包鹏甲,梁春年,吴晓云,刘建,阎萍. 2013

[11]植物的单核苷酸多态性及其在作物遗传育种中的应用. 郝岗平,杨清,吴忠义,曹鸣庆,黄丛林. 2004

[12]草原红牛CAPN1基因第5外显子多态性与肉质性状的相关研究. 曹阳,牛春华,张国梁,金海国. 2009

[13]ARMS-PCR在水稻米香基因Fgr检测中的应用. 陈晓军,王敬东,殷延勃,马洪文,宋玉霞. 2011

[14]三疣梭子蟹线粒体基因组单核苷酸多态性. 赵莲,李志辉,张培,薛蓓,赖晓芳,高焕,阎斌伦. 2018

[15]三疣梭子蟹线粒体基因组SNP在增殖放流家系识别中的应用. 赵莲,李志辉,张培,薛蓓,赖晓芳,张庆起,高焕,阎斌伦. 2018

[16]SNP分子标记技术在经济甲壳动物中的应用进展. 赵莲,薛蓓,高焕,阎斌伦. 2017

[17]草原红牛改良群体H-FABP基因SNP及其与肉质性状的相关分析. 文力正,赵玉民,姜昊,张国梁,戴立胜,赵志辉,陈承祯,张嘉保. 2008

[18]斑点叉尾MSTN基因4个SNP位点及其与生长性状的相关性. 张世勇,王明华,钟立强,秦钦,潘建林,陈校辉,边文冀. 2017

[19]猪Toll样受体4基因SNPs功能分析. 杨秀芹,陈月婵,汪亮,李海涛,刘娣,关庆芝,付博. 2012

[20]绿壳蛋鸡与白来航蛋鸡microRNA变异及其靶基因预测分析. 管毓渝,廖荣荣,王振,赵静,陈振亮,张哲,肖倩,孙浩,王起山. 2016

作者其他论文 更多>>

微信小程序