侵染贵州火龙果的仙人掌X病毒基因组序列分离与变异分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郑乾明

作者： 郑乾明;柏自琴;王小柯;林乾;王彬;马玉华

作者机构：

关键词： 仙人掌X病毒;宏转录组测序;遗传变异;序列一致性

期刊名称： 贵州农业科学

ISSN： 1001-3601

年卷期： 2022 年 50 卷 004 期

页码： 1-7

收录情况： 北大核心

摘要： [目的]分析侵染贵州火龙果的仙人掌X病毒(Cactus virus X,CVX)及其NTU株系的基因组序列遗传变异,为建立分子检测和防控体系奠定理论基础.[方法]对感染病毒的样品采用宏转录组测序和生物信息学分析,分离病毒基因组序列并分析分子变异和系统进化.[结果]获得4条CVX(CVX-LW、CVX-RF、CVX-ZNS 和 CVX-ZYP)和5条 CVX-NTU(CVX-NTU-LW、CVX-NTU-RF、CVX-NTU-ZNF、CVX-NTU-ZNS和CVX-NTU-ZYP)贵州火龙果分离物近全长基因组序列,长度为6 494~6 603 bp,覆盖参考基因组96.2%~99.6%;CVX贵州分离物之间的基因组序列一致性为98.3%~98.6%,与已报道的其他分离物基因组序列一致性为97.1%~98.0%;CVX-NTU贵州分离物之间的基因组序列一致性为98.1%~98.8%,与已报道的其他分离物基因组序列一致性为97.6%~99.1%;CVX和CVX-NTU群体未出现明显的遗传分化.[结论]研究获得的CVX和CVX-NTU贵州火龙果分离物近全长基因组序列表现较高的一致性,未发生明显遗传变异.

分类号： S436.412

  • 相关文献

[1]利用高通量测序分析侵染贵州火龙果的病毒. 郑乾明,王壮,彭志军,马玉华,蔡永强. 2017

[2]侵染红肉火龙果的蟹爪兰X病毒贵州分离物基因组分析. 郑乾明,王小柯,王壮,马玉华. 2019

[3]甜瓜黄花斑点病毒在中国大陆的首次发现. 古勤生,吴会杰,张学军,吴明珠,王登明,彭斌,柳唐镜,孔祥义. 2010

[4]侵染贵州火龙果的蟹爪兰X病毒和火龙果X病毒基因组序列差异和遗传变异. 郑乾明,王小柯,马玉华. 2022

[5]魁蚶4个地理群体ITS序列变异及系统发生分析. 周丽青,杨爱国,王清印,吴彪,于涛. 2012

[6]利用AFLP标记对鄂西多花木蓝材料遗传变异的分析. 罗天琼,张建波,莫本田,张瑜,龙忠富,王普昶. 2016

[7]二棱大麦数量性状的多元遗传分析. 刘志萍,张凤英,包海柱. 2009

[8]两种壳色虾夷扇贝的同工酶分析. 孙秀俊,杨爱国,刘志鸿,周丽青,王卫军. 2009

[9]东北大豆种质资源生育期性状的生态特征分析. 傅蒙蒙,王燕平,任海祥,王德亮,包荣军,杨兴勇,田中艳,傅连舜,程延喜. 2016

[10]转双价抗虫基因棉花的主要农艺性状的遗传变异. 徐泽俊,聂以春,张献龙,郭小平,吴家和. 2011

[11]核果类果树主要性状遗传变异规律研究进展. 孙猛,刘威生,刘宁,王晓松. 2011

[12]百宜黑鸡与兴义矮脚鸡、长顺绿壳蛋鸡的遗传变异研究. 阳光远,王文涛,张小林,傅筑荫,陈彬. 2011

[13]瑶山鸡TRHR基因编码区序列SNP检测及其与繁殖性状的相关性. 伍革民,徐龙鑫,朱丽莉,唐继高. 2017

[14]荔波瑶山鸡NSG1基因变异检测及与繁殖性状关联分析. 伍革民,徐龙鑫,朱丽莉,唐继高. 2017

[15]甘肃小麦HMW-麦谷蛋白亚基遗传变异分析. 杨芳萍,李望鸿. 2003

[16]龙眼杂交后代果肉黄酮含量的遗传倾向研究与优株筛选. 黄爱萍,郑少泉. 2011

[17]百宜黑鸡mtDNA D-loop区遗传变异分析. 阳光远,张小林,王文涛,傅筑荫,陈彬. 2011

[18]拷贝数变异的研究方法及其在畜禽中的研究进展. 王继英,郭建凤,张大龙,王彦平,陶海英,武英. 2013

[19]贵州不同宿主布氏杆菌分离与遗传关系. 史开志,毛君婷,姜玲玲,徐洪忠,尚以顺,吴卫珩. 2014

[20]长顺绿壳蛋鸡mtDNA D-loop区遗传多样性分析. 韩雪,朱丽莉,粟朝芝,陶宇航. 2015

作者其他论文 更多>>

微信小程序