1个侵染贵州火龙果的仙人指X病毒新的分离物基因组序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郑乾明

作者： 郑乾明;王小柯;马玉华

作者机构：

关键词： 火龙果;仙人指X病毒;外壳蛋白;序列一致率;系统进化关系

期刊名称： 贵州农业科学

ISSN： 1001-3601

年卷期： 2025 年 53 卷 001 期

页码： 83-89

收录情况： 北大核心

摘要： 【目的】分离侵染贵州火龙果的仙人指X病毒（Schlumbergera virus X, SchVX）基因组全长序列，了解其系统进化和遗传变异，为开展贵州火龙果病毒检测和防控奠定基础。【方法】从前期开展的火龙果成熟茎全长转录组测序获得的转录本中筛选SchVX相关序列，开展开放读码框（Open reading frame, ORF）预测、序列注释、一致率计算和系统进化分析。【结果】获得SchVX贵州火龙果分离物基因组序列，命名为SchVX-GZpitaya，基因组全长为6 616 bp, 5′和3′非翻译区（Untranslated region, UTR）长度分别为85 bp和101 bp。SchVX-GZpitaya与目前已报道SchVX分离物的基因组序列一致率为77.8%～78.4%，与其他侵染火龙果的马铃薯X病毒属病毒序列一致率为70.3%～73.0%。SchVX-GZpitaya编码的RNA依赖RNA聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase, RdRP）与K11、Palma-PE、nopal verdura 1和DSMZ PV-0083分离物的氨基酸序列一致率为87.4%～88.3%，外壳蛋白（Coat protein, CP）的氨基酸序列一致率为87.1%～91.6%。基于全基因组或CP蛋白氨基酸序列的系统进化分析表明，SchVX-GZpitaya与目前已报道SchVX分离物的亲缘关系较近，但形成单独的一类。【结论】SchVX-GZpitaya是SchVX来自贵州火龙果的1个新分离物，其基因组序列与目前已报道的各类SchVX存在较大差异。

分类号： S436.67

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