棉属四倍体AD_1与二倍体A_2、D_5基因组的同源SSR分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孙高飞

作者： 孙高飞;何守朴;潘兆娥;杜雄明

作者机构：

关键词： SSR;棉花基因组;同源SSR;进化

期刊名称： 遗传

ISSN： 0253-9772

年卷期： 2015 年 37 卷 02 期

页码： 192-203

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： SSRs(Simple sequence repeats)是一类广泛存在于动植物基因组的DNA短串联重复序列,是重要的基因组分子标记。比较不同基因组同源SSR的差异,有利于了解相近物种间的进化过程。文章使用雷蒙德氏棉基因组(D5)、亚洲棉基因组(A2)全基因组序列和陆地棉(AD1)的限制性酶切基因组测序数据,进行全基因组SSR扫描,比较了A组和D组的SSR分布情况,通过识别3个基因组之间的同源SSR,比较它们之间同源SSR重复序列的差异。结果发现,A组和D组同源SSR的分布规律非常相似,但A组与AD组的同源SSR保守性比D组与AD组同源SSR的保守性强。与AD组同源SSR相比,A组中重复序列长度增长的SSR数量约为长度缩短的SSR数量的5倍,在D组中这一比值约为3倍。可以推测,四倍体AD组在与A组、D组的平行进化过程中,由于基因组融合,导致SSR的重复序列长度变化速率与二倍体A、D组有差异,同时这种差异可能导致了AD组SSR重复序列长度在进化过程中与二倍体相比有变短的趋势。文章首次对3个棉花基因组的同源SSR进行了系统地比较,发现了同源SSR在棉属四倍体基因组和二倍体基因组中的显著差异,为进一步揭示棉属基因组的进化规律提供了基础。

分类号： S562

  • 相关文献

[1]猪流感的再认识. 仇华吉,童光志. 2000

[2]禾本科小麦族三个物种的核型及进化关系分析. 林小虎,李兴锋,王黎明,赵逢涛,王洪刚. 2005

[3]外生菌根菌植多样性及其进化. 桂阳,刘作易. 2006

[4]6个紫花苜蓿材料的核型及其亲缘关系分析. 张雪婷,杨文雄,杨芳萍,师尚礼,尹国丽. 2011

[5]芝麻染色体核型及似近系数分析. 张海洋,苗红梅,李春,魏利斌,马琴. 2012

[6]近百年来全球气候变暖的倾向和甲型流感病毒神经氨酸酶进化的倾向(英文). 左文朴,朱绮霞,黄艳燕,潘丽霞,吴光. 2010

[7]古菌、细菌和真核生物纤维素酶的整体进化关系（英文）. 吴光. 2016

[8]用微分方程组的解析解拟合甲型流感病毒聚合酶酸性蛋白家族的进化过程(英文). 吴光. 2010

[9]中国沙棘雌雄株的染色体核型分析. 王彬,朱春云,王志涛,辛永清. 2010

[10]中国沙棘染色体核型及进化研究. 王彬. 2011

[11]SOS应答系统及其对细菌耐药性和毒力的调控作用与在治疗细菌感染中的应用. 王进文,白华,颜世敢,胡明,刘玉庆. 2014

[12]基于Agent的植物生长系统体系结构. 李晓明,赵春江,郑萍. 2010

[13]家蚕杆状病毒半胱氨酸蛋白酶基因的序列分析及表达. 林旭瑷,张志芳,李卫国,何家禄,尚金燕. 2002

[14]大豆种质资源遗传多样性研究进展. 何真,韵晓东,武凯,姬虎太,常建忠,乔麟轶,郑军. 2015

[15]畜禽动物中长链非编码RNA的研究现状. 戴梦红,陆启荣,程古月,李丽,刘孟轲,郝海红,王旭,袁宗辉. 2016

[16]植物钙依赖性蛋白激酶的进化和功能研究进展. 耿帅锋,赵永亮,李爱丽,毛龙,王卫国,李磊. 2010

[17]真正柑橘果树类植物基于AFLP分子标记的分类与进化研究. 谢让金,周志钦,邓烈. 2008

[18]大豆和百脉根古老原核基因的全基因组鉴定与比较分析. 韦兴燚,李昱,刘文献,金小煜,闵学阳,张正社,Ndayambaza Boniface,王彦荣. 2018

[19]胡萝卜DcBMT基因的克隆及其在根发育过程中的表达. 谭国飞,钟秀来,罗庆,王天文,孟平红. 2020

[20]UFD2结构域在棉花和其他24种植物中的进化分析. 舒娜,舒娜,崔瑞峰,韩明格,王帅,王德龙,樊伟丽,王俊娟,郭晓宁,郭丽雪,叶武威. 2017

作者其他论文 更多>>

微信小程序