用线粒体D-loop和Cyt b基因序列分析拉氏3个群体的遗传结构和遗传分化

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨培民

作者： 杨培民;胡宗云;金广海;刘义新;王雷;骆小年

作者机构：

关键词： 拉氏;D-loop;Cyt b;遗传多样性;遗传分化

期刊名称： 水产学杂志

ISSN： 1005-3832

年卷期： 2017 年 04 期

页码： 7-12+27

摘要： 用线粒体DNA的D-loop和Cyt b基因序列分析方法研究了吉林延吉、敦化和辽宁法台3个区域的29尾拉氏Phoxinus lagowskii Dybowsky的遗传多样性。经PCR扩增和测序,获得了783~785bp D-loop和818bp Cyt b的同源序列。两者多态性遗传参数统计显示,29尾个体分别存在47(D-loop)和89(Cyt b)个变异位点,分别检测出15(D-loop)和11(Cyt b)个单倍型,总群体单倍型(H_d)分别为0.8966(D-loop)和0.8990(Cyt b),核苷酸多样性指数(Pi)分别为0.0246(D-loop)和0.0498(Cyt b),平均核苷酸差异数(K)分别为19.2857(D-loop)和40.7365(Cyt b)。分子方差分析(AMOVA)结果表明,79.02%(D-loop)和81.69%(Cyt b)变异来自群体间,20.98%(D-loop)和18.31%(Cyt b)来自群体内。单倍型呈明显的地理差异,分成2个分支,一个以延吉群体为主,一个以法台群体为主。拉氏的遗传多样性水平较高,群体间遗传分化明显。该结果可为拉氏的种质资源保护提供参考。

分类号： S917.4

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