普通烟草ATⅢ氨基转移酶家族序列鉴定与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王晓

作者： 王晓;王大伟;夏菲;李晓旭;吴华;姜山;孙玉合

作者机构：

关键词： ATⅢ氨基转移酶家族;普通烟草;生物信息学分析

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2019 年 01 期

页码： 251-259

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 氨基转移酶是5'-磷酸吡哆醛依赖酶,在植物的生长发育和非生物胁迫的反应中起重要作用。ATⅢ氨基转移酶家族(classⅢ aminotransferase family)是转氨酶家族中一个非常重要的亚家族。本研究利用普通烟草(Nicotiana tabacum)基因组序列信息,鉴定出26个ATⅢ家族成员,对烟草ATⅢ家族进行理化性质分析表明,普通烟草ATⅢ家族成员之间的理化性质差异较大;系统进化和结构域分析显示,烟草ATⅢ家族成员可形成4个分支,同一分支内ATⅢ家族成员的保守结构域的种类和组织形式高度一致;将19个家族成员定位在12条染色体上;分析普通烟草转录组数据,结果显示大多数家族成员在不同组织中都有表达,主要集中在叶脉、打顶后茎和叶、离体叶片等组织。对NtATⅢ1和NtATⅢ2基因的qRT-PCR分析显示,这两个基因主要在植物地上组织中表达。本研究为普通烟草ATⅢ基因的功能研究提供依据。

分类号： S572`Q943.2

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