鲁道夫对盲囊线虫C新种的ITS rDNA序列测定及种系发育关系分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张媛

作者： 张媛;林瑞庆;赵光辉;袁子国;宋慧群;朱兴全

作者机构：

关键词： 鲁道夫对盲囊线虫C种;内转录间隔区;rDNA;种系发育关系分析

期刊名称： 中国兽医科学

ISSN： 1673-4696

年卷期： 2009 年 39 卷 04 期

页码： 298-302

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以鲁道夫对盲囊线虫C种为研究对象,对其rDNA的内转录间隔区(ITS)序列进行PCR扩增、测序和序列分析,以ClustalⅩ1.81程序对序列进行比对,然后用MEGA4.0程序的MP法和NJ法及PUZ-ZLE4.1程序的ML法构建鲁道夫对盲囊线虫A、B、C种以及北方对盲囊线虫的种系发育关系。结果显示,鲁道夫对盲囊线虫C种的ITS-1,5.8 S,ITS-2序列大小分别为451 bp、127 bp和277 bp,鲁道夫对盲囊线虫3个种与北方对盲囊线虫ITS序列种内差异小,种间差异明显。种系发育关系分析发现,这3种方法(NJ法、MP法和ML法)构建的种系发育树的拓扑结构基本一致,其中C种和A种聚在一起,构成一支,再和B种聚在一起;北方对盲囊线虫单独成一支。研究结果证明鲁道夫对盲囊线虫C种确为一新种。

分类号： S941`S852.7

  • 相关文献

[1]鲁道夫对盲囊线虫C新种的ITSrDNA序列测定及种系发育关系分析. 张媛,林瑞庆,赵光辉,袁子国,宋慧群,朱兴全. 2009

[2]浙江地区不同寄主来源的炭疽菌ITS序列PCR-RFLP多态性分析. 刘诗胤,邱海萍,姜华,张震,柴荣耀,毛雪琴,王教瑜,杜新法,王艳丽,孙国昌. 2012

[3]日本沼虾ITS1序列分析及SNPs位点的筛选. 张洪伟,傅洪拓,吴滟,龚永生,王庆,夏德全. 2010

[4]基于ITS序列探讨南瓜属植物系统发育. 吴宇芬,周先治,陈晟,陈阳,赵依杰. 2010

[5]18个贵州红托竹荪种质资源的遗传多样性. 卢颖颖,桂阳,龚光禄,魏善元,朱国胜. 2014

[6]天津地区保护地蔬菜根结线虫种类的分子鉴定. 霍建飞,任文来,刘春艳,王勇,田涛,郝永娟,王万立,万久兴. 2012

[7]基于rDNA-ITS和组蛋白3基因序列分析鉴定新疆棉花叶斑病病原. 李映程,张国丽,任毓忠,李海强,武刚,李天义,李国英,张莉. 2018

[8]新月弯孢CLE菌株胞外蛋白对水稻纹枯病的诱导抗性及其菌种鉴定. 王玲,黄世文,唐绍清,朱德峰,王磊. 2008

[9]两株椰心叶甲分离物的鉴定及其系统发育分析. 郭立佳,黄俊生,宋妍,许天委. 2007

[10]甘肃首次发现大豆孢囊线虫(Heteroderaglycines). 彭德良,黄文坤,徐秉良,彭焕. 2015

[11]黑龙江省大豆菌核病菌核盘菌遗传多样性分析. 董利东,王金生,李文滨,吴俊江,范素杰,徐鹏飞,张淑珍. 2015

[12]rDNA ITS序列在果树真菌病害研究中的应用. 索相敏,王献革,李学营,郝婕,鄢新民,冯建忠. 2015

[13]番石榴焦腐病菌LAMP检测方法的建立及应用. 吴敏亮,张溢溪,兰成忠,刘裴清,李本金,陈庆河,翁启勇. 2013

[14]奥利亚罗非鱼与尼罗罗非鱼rDNA内转录间隔区序列特征. 陈雪峰,李红霞,俞菊华,唐永凯,李建林. 2009

[15]我国不同地区熊蜂短膜虫的感染情况及亲缘关系. 唐裕杰,王刘豪,李凯,李继莲. 2019

[16]白菜类作物ITS序列分析. 高玉梅,张淑江,章时蕃,李菲,王晓武,武剑,孙日飞. 2009

[17]我国耳萝卜螺ITS及5.8SrDNA的克隆及序列分析. 王瑞爱,刘国华,王春仁,张念章,翁亚彪. 2013

[18]内转录间隔区1(ITS-1);用于伊氏锥虫遗传多样性分析的一个争议性标记基因. 田占成,刘光远,谢俊仁,沈辉,张丽艳,张萍,罗金. 2011

[19]我国耳萝卜螺ITS及5.8S rDNA的克隆及序列分析. 王瑞爱,刘国华,王春仁,张念章,翁亚彪. 2013

[20]CO1在侧耳属物种快速鉴定中的应用. 宋驰,陈强,徐璟煜,张金霞,边银丙,黄晨阳. 2011

作者其他论文 更多>>

微信小程序