陆地棉耐盐相关SNP筛选和鉴定

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王晓歌

作者： 王晓歌;王晓歌;舒娜;王俊娟;陆许可;陈修贵;王德龙;王帅;郭丽雪;陈超;叶武威

作者机构：

关键词： 陆地棉(Gossypium hirsutum);耐盐;70 K SNP芯片

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2020 年 004 期

页码： 1202-1210

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 盐胁迫是限制作物产量提高的一个主要非生物因素.棉花是盐碱地的先锋作物,研究棉花的耐盐性,筛选耐盐相关分子标记,对充分利用棉花的耐盐性及棉花耐盐种质鉴定有重要意义.在本研究中,我们对前期筛选到的1 281个耐盐相关候选SNP即SNPr (SNP related to salt tolerance)进行分析,利用BEDTools软件获得位于基因上的SNPr,并使用AgriGO (http://bioinfo.cau.edu.cn/agriGO/)和KAAS (http://www.genome.jp/tools/kaas/)网站对这些基因进行GO和KEGG分析.借助perl编程,获得非同义SNPr.分析发现,1 281个SNPr中,有353个位于基因上,其中247个位于基因外显子区,且有174个是非同义SNPr.从中选择12个非同义SNPr,使用CAPS/dCAPS引物进行验证,并结合田间耐盐鉴定的结果,最终得到1个与耐盐相关的SNPr.这个SNPr位于CHD3/CHD4家族基因上,可能与盐胁迫过程中的表观修饰有关.

分类号： S562

  • 相关文献

[1]耐盐转基因大豆事件FA8015旁侧序列分离及定性PCR检测. 马阔,仲晓芳,牛陆,赵倩倩,杨向东. 2018

[2]大麦种质耐盐性鉴定及评价. 乔海龙,沈会权,陈健,陶红,臧慧,栾海业,张英虎,陈和. 2015

[3]NAC转录因子在植物抗非生物胁迫基因工程中的应用进展. 段俊枝,李莹,赵明忠,李清州,张莉,魏小春,任银铃. 2017

[4]水稻转录因子Os1137的克隆及其耐盐性分析. 邢国杰,马建,高明,谭化,刘艳芝. 2014

[5]杨树叶中Na~+的积累与其耐盐能力的关系. 杨迎霞,郏艳红,聂莉莉,张越,陈受宜,王景安,刘仲齐. 2009

[6]糯玉米离体培养获取耐盐变异体. 陆瑞菊,何婷,王亦菲,陈志伟,杜志钊,张燕敏,黄剑华,陈佩度,沈雪芳,王义发. 2009

[7]海滨锦葵新品系比较试验. 王康,何林池,魏小云,邢建美. 2015

[8]NAC转录因子在水稻抗逆基因工程中的应用进展. 段俊枝,李莹,赵明忠,魏小春,任银铃. 2017

[9]QTL技术在水稻耐盐育种上的应用. 谢树鹏,李俊峰,张广彬,聂守军,高世伟,刘立超. 2010

[10]水稻耐盐育种研究进展. 孙明法,严国红,王爱民,朱国永,唐红生,何冲霄,任仲玲,刘凯,张桂云,施伟,赵绍路,孙一标,朱静雯,宛柏杰,姚立生. 2017

[11]作物耐盐性状研究进展. 王为,潘宗瑾,潘群斌. 2009

[12]水稻耐盐基因遗传及耐盐育种研究. 胡婷婷,刘超,王健康,丁成伟,郭荣良,吴玉玲,徐家安,王友霜. 2009

[13]不同基因型菊芋品种对盐胁迫的响应. 冯营,胡新燕,孙亚伟,王阶祥,李卫华. 2013

[14]转BADH和Bar基因水稻培育及其相关特性评价. 金曦,罗伯祥,陈受宜,肖国樱. 2011

[15]糯玉米芽苗期耐盐性鉴定及相关分子标记筛选. 印志同,杨庆华,倪正斌,罗标,卞云龙,王益军,徐辰武,邓德祥. 2012

[16]日光温室盆栽非洲菊栽培基质筛选及耐盐性分析. 王江英,赵统利,邵小斌,朱朋波,汤雪燕,孙明伟,惠林冲. 2018

[17]49种山茶在低温和盐胁迫下的双抗能力分析. 王江英,赵统利,朱朋波,李纪元,汤雪燕,孙明伟,惠林冲,邵小斌. 2019

[18]盐胁迫对柳L0911生理指标的影响. 李敏,张健,李玉娟,冯立国. 2012

[19]水稻耐盐性的遗传及育种研究进展. 程保山,袁彩勇,罗伯祥,王健,李刚,徐卫军. 2016

[20]耐盐植物马齿苋的特性及其利用研究进展. 刘冲,洪立洲,王茂文,丁海荣,朱小梅,邢锦城,赵宝泉. 2011

作者其他论文 更多>>

微信小程序