海南岛巴西橡胶和香蕉cat相关基因的克隆及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 余乃通

作者： 余乃通;孙玉娟;张雨良;罗志文;刘志昕

作者机构：

关键词： 香蕉;巴西橡胶;cat基因;克隆;序列分析

期刊名称： 植物研究

ISSN： 1673-5102

年卷期： 2012 年 32 卷 01 期

页码： 47-53

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据GenBank上已有的植物cat基因序列,设计一对兼并引物。在海南岛采集香蕉、巴西橡胶、黄灯笼辣椒、菠萝、甘蔗、番木瓜等作物的叶片并提取总RNA,反转录成cDNA,PCR进行同源克隆。结果获得了巴西橡胶cat-1和香蕉的cat-2基因,而未获得其它4种作物cat相关基因。序列分析发现,巴西橡胶cat-1和香蕉的cat-2基因开放阅读框(ORF)都为1 479 bp,编码492个氨基酸,GenBank登陆号分别为HQ660587和HQ660588。生物信息学软件分析巴西橡胶CAT-1和香蕉CAT-2蛋白的三级结构分别与Exiguobacteriu Oxidotolerans(PDB code:2j2mA0)和Pseudomonas Syringae(PDB code:1m7sA)相似。构建系统发育树表明巴西橡胶CAT-1与蓖麻CAT-1氨基酸序列(Ricinus communis:XP_002521709.1)同源性最高,为92.1%;香蕉CAT-2与油棕CAT-2氨基酸序列(Elaeisguineensis:ACF06566.1)同源性最高,达90.9%。

分类号： S668.1`S794.1

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