东乡野生稻与日本晴多态性标记的开发

文献类型: 中文期刊

第一作者: 马小定

作者: 马小定;唐江红;张佳妮;崔迪;李慧;黎毛毛;韩龙植

作者机构:

关键词: InDel标记;基因组重测序;粳稻

期刊名称: 作物学报

ISSN: 0496-3490

年卷期: 2019 年 02 期

页码: 316-321

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 东乡野生稻是分布于全球最北端的一种普通野生稻,与亚洲栽培稻基因组差异较大,目前缺少覆盖其全基因组的分子标记。本文以东乡野生稻和日本晴为材料,通过筛选已有的1017个标记,并利用东乡野生稻基因组重测序信息设计的217个InDel标记,共检测出203个标记在东乡野生稻与日本晴间呈现多态性。这些标记均匀分布于12条染色体,平均间隔1.9 Mb,基本覆盖东乡野生稻全基因组区域。通过对籼粳亚种的检验分析,发现该套多态性分子标记在东乡野生稻与粳稻杂交后代群体基因型分析上具有较高的应用价值。本研究结果为发掘东乡野生稻的有利基因以及分子标记辅助选择育种提供了有力的工具。

分类号: S511

  • 相关文献

[1]基于重测序的槟榔InDel标记开发及应用. 齐兰,杨耀东,黄丽云,杨玉娟,尹永梅. 2024

[2]基于木薯全基因组重测序的InDel标记开发及应用. 陆佳毓,王明,肖鑫辉,李开绵,张洁,薛茂富,符乃方,万仲卿,王颜. 2024

[3]基于名优谷子品种晋谷21全基因组重测序的分子标记开发. 赵庆英,张瑞娟,王瑞良,高建华,韩渊怀,杨致荣,王兴春. 2018

[4]锦鲤基因组数据分析及体色相关基因的筛选. 史东杰,胡金有,朱华,张欣,李荣妮,孙砚胜. 2019

[5]基于基因组重测序信息构建玉米第5染色体的片段代换系. 林峰,葛敏,宝华宾,赵涵. 2015

[6]13个杂交水稻亲本产量性状基因等位变异. 蒋平,胡运高,高方远,吕建群,刘松,郭鸿鸣,刘利平,任国胜,苏相文,任明鑫,任光俊,任鄄胜. 2024

[7]基于基因组重测序的高含量油酸转基因大豆T-DNA旁侧序列分析及事件特异性PCR检测. 仲晓芳,杨静,贺红利,牛陆,邢国杰,杨向东. 2018

[8]基于基因组重测序的长江上游瓦氏黄颡鱼群体遗传结构. 熊飞,刘红艳,翟东东,段辛斌,田辉伍,陈大庆. 2023

[9]希尔斯山羊草1SsS和3SsS染色体特异dCAPS标记的建立. 倪佳俊,韩冉,徐文竞,王开,祁广,曾小雪,訾妍,李豪圣,刘建军,汪晓璐,刘成. 2023

[10]水稻雄性不育突变体012S-3的遗传分析和基因定位. 欧阳杰,王楚桃,朱子超,何永歆,蒋刚,黄乾龙,管玉圣,熊英,李贤勇. 2015

[11]中外猪种间生长发育相关的差异候选基因筛选. 陶璇,梁艳,杨雪梅,汪勇,杨跃奎,孔繁晶,王言,龚建军,朱康平,卫纪,杨少鹏,吕学斌,顾以韧,何志平. 2024

[12]香菇菌落角变菌丝生长情况及分析. 张丹,徐蒋振,董浩然,万佳宁,谭琦,宋春艳. 2025

[13]基于基因组重测序技术筛选小尾寒羊高繁基因的研究. 方文文,缪立生,刘宇,王维婷,刘昭华,杨少滢,王可,曹阳. 2024

[14]圆斑星鲽雌性特异DNA分子标记开发及遗传性别鉴定方法的建立. 郑卫卫,徐文腾,刘洋,陈亚东,杨涛,席晓晴,刘志鸿,徐东,秦搏,陈松林. 2025

[15]基于重测序的印度南瓜种质资源遗传多样性分析. 刘静,徐玉婷,黄钰,曾庆国,丁兰,黄伟忠,王尖,许小江. 2025

[16]玉米耐酸性土壤分子标记的图谱整合及多态性. 王伟,杨文鹏,王明春. 2014

[17]水稻InDel和SSR标记多态性的比较分析. 冯芳君,罗利军,李荧,周立国,徐小艳,吴金红,陈宏伟,陈亮,梅捍卫. 2005

[18]一个与花生含油量相关的InDel标记的开发. 徐平,尹亮,石延茂,任艳,王效华,李双铃,袁美. 2017

[19]利用Indel标记鉴定‘豫甘3号’结球甘蓝种子纯度. 杨双娟,原玉香,魏小春,王志勇,赵艳艳,姚秋菊,蒋武生,张晓伟. 2018

[20]基于重测序番茄InDel标记的开发. 张国儒,唐亚萍,杨涛,帕提古丽,王柏柯,李宁,王娟,李晓琴,余庆辉,杨生保. 2019

作者其他论文 更多>>