利用抑制差减杂交技术分离茄子单性结实相关ESTs

文献类型： 中文期刊

第一作者： 周亚君

作者： 周亚君;陈钰辉;刘富中;张映;连勇

作者机构：

关键词： 茄子;单性结实;抑制差减杂交

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2010 年 37 卷 12 期

页码： 1944-1952

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以茄子(Solanum melongena)单性结实品系D-10和非单性结实品系03-2的子房cDNA分别为试验组(Tester)和驱动组(Driver),利用抑制差减杂交(SSH)技术构建了正反两个SSH-cDNA文库,分别包含472和124个克隆。通过测序、序列拼接后,共获得384个Unique ESTs。将其与非冗余蛋白数据库进行BLASTx比对,在E值小于等于1e-10条件下,有257个ESTs能找到相匹配的蛋白质,其中121个ESTs与非冗余蛋白质数据库中已知功能的蛋白质具有高度的相似性。功能注释结果表明,具生物过程、分子功能和细胞组分的EST分别为107、102和119条。推测与单性结实相关的EST有5条:2条ESTs属于MADS-box转录因子家族,1条与生长素增长蛋白同源,1条属于P450还原酶系,1条属于MAPKK家族;另外136个ESTs代表了未知功能基因。

分类号： S641.1

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