野菊花NBS-LRR基因家族的鉴定和生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 叶福民

作者： 叶福民;闫烨;张晓波;张文洋;李振;徐敏;庄得凤;阮芳

作者机构： 辽宁省经济作物研究所;内蒙古民族大学农学院

关键词： 野菊花;基因家族;R基因;NBS-LRR;生物信息学

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2025 年 23 卷 006 期

页码： 1790-1799

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： NBS-LRR类基因是植物R基因中最大的一类，对于抵抗病原体侵染发挥重要作用。本研究利用生物信息学，从野菊花的56 870个基因中，筛选出343个编码NBS类蛋白的基因，其中N型218个，NL型17个，CNL型15个。进一步对野菊花中同时包含NBS和LRR结构域的32个植物抗病基因(NBS-LRR)家族成员的基本理化性质、蛋白质的亚细胞定位、进化树的构建、基因结构、保守结构域和保守基序进行分析。结果发现野菊花NBS-LRR基因家族主要定位在细胞质和细胞膜上，推测其与保证细胞正常活动和防止病原菌进入细胞内部有一定关联。32个NBS-LRR基因中有17个蛋白序列的稳定性较差；31个蛋白序列具有亲水性。进化树分析结果表明CNL和NL两种类型的基因进化路径的相似性较高。保守性分析表明，motif 1、motif 2的保守基序的保守性较高。顺式作用元件分析表明该家族成员可能参与生长素、赤霉素、脱落酸等激素响应，抵御非生物胁迫。转录组分析表明NBS-LRR基因家族在同为菊科作物的杭白菊各部位正常生长时普遍处于自动抑制状态。该研究为进一步挖掘野菊花中的功能性R基因提供一定的参考。

分类号： Q943.2

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