新城疫病毒非结构蛋白W的分子特征及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 钱晶

作者： 钱晶;欧阳伟;王晶宇;孙伟伟;王晓丽;夏兴霞;诸玉梅;王永山

作者机构：

关键词： 新城疫病毒;非结构蛋白W;分子特征;生物信息学分析

期刊名称： 中国兽医学报

ISSN： 1005-4545

年卷期： 2020 年 40 卷 003 期

页码： 517-523

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 新城疫病毒W蛋白是由P基因“RNA编辑”产生的最短非结构蛋白.为了解W蛋白的分子特征,本试验利用生物信息学软件对24株遗传背景清晰的病毒信息进行分析.结果 显示,不同毒株W蛋白序列长度各有不同,存在8种不同长度(137aa、147aa、155aa、179aa、183aa、196aa、221aa和227aa),其变异呈现基因型一致性,不同基因型毒株W蛋白长度差异又与强、弱毒特征存在一定相关性.蛋白质分析软件预测结果显示,W蛋白上糖基化位点和磷酸化位点数量与其长度呈正相关性.W蛋白存在稳定的核定位信号,提示其功能活动区可能在细胞核.W蛋白长度的差异是通过改变C端结构域长度来实现的,经二级结构预测发现基因Ⅱ型(中强毒株)和基因Ⅲ、Ⅵ和Ⅶ型强毒株的C端结构域比其他毒株多出1个α-螺旋结构,推测W蛋白可能是NDV强毒株上关键的新型毒力标志.

分类号： S852.65

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