新疆喀什地区安格斯犊牛腹泻主要病毒性病原调查及牛诺如病毒全基因序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴静

作者： 吴静;史晋成;萨妮耶·库尔班;纳曼·阿卜杜拉;孙磊;姚刚;钟旗;骆梁涛;赵红琼;马雪连

作者机构：

关键词： 犊牛腹泻;病毒性病原;流行病学调查;遗传进化分析

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN：

年卷期： 2022 年 011 期

页码： 4420-4428

收录情况： 北大核心

摘要： 【目的】调查新疆喀什地区安格斯犊牛腹泻主要病毒性病原流行情况及牛诺如病毒（Bovine norovirus, BNoV）全基因组遗传关系。【方法】采用RT-PCR技术分别对2021年不同季节在喀什4个牛场采集的363份犊牛腹泻粪便样品进行牛轮状病毒（Bovine rotavirus, BRV）、牛冠状病毒（Bovine coronavirus, BCoV）、牛病毒性腹泻病毒（Bovine viral diarrhea virus, BVDV）和BNoV 4种病毒性病原检测，并对扩增获得的BNoV全基因序列进行分析。【结果】BCoV和BNoV检出率较高，分别为36.09%（131/363）和25.07%（91/363）,混合感染中BCoV+BNoV检出数量最多，阳性率为44.00%（22/50）。对喀什地区4个场区进行检测，其中A场主要检测出BCoV和BNoV,检出率分别为43.52%（47/108）和32.41%（35/108）;B场主要检测到BCoV,检出率为52.21%（71/136）;C、D场病原检出率普遍较低。秋、冬季检出量最多的病毒分别为BNoV和BCoV,检出率分别为66.67%（50/75）和77.59%（90/116）。对BNoV全基因序列分析显示，本试验检测到的新疆喀什地区BNoV Bo/XJ-KS/01/CHN株（登录号：ON076888）属于GⅢ.2型BNoV,与中国CN/HB-SJZ和CH/HB/BD/2019毒株在进化树中处于同一分支，且与CN/HB-SJZ-2毒株核苷酸相似性最高，为93.70%;与英国分离到的Jena/1999/UK毒株核苷酸相似性最低，为72.49%。进一步对3个开放阅读框（ORF）比对分析发现，测得的BNoV全基因组序列与国内参考株CN/HB-SJZ-2的核苷酸和氨基酸相似性主要是在ORF1区域最高，分别为94.24%和98.69%;与国外参考株Jena/1999/UK的核苷酸和氨基酸相似性主要是在ORF3区域最低，分别为63.59%和64.57%。与国内外毒株比对结果显示，未出现基因重组现象。【结论】南疆地区犊牛腹泻流行情况因季节、场区不同有一定的差异。病毒性病原主要在秋、冬季感染率较高，以单一BCoV、BRV和BNoV感染为主。本研究测定分析的BNoV GⅢ.2型Bo/XJ-KS/01/CHN全基因序列与中国CN/HB-SJZ-2参考株亲缘关系最近，与国内外全基因组参考序列比对未出现基因重组现象。

分类号： S852.653

  • 相关文献

[1]新疆地区犊牛冠状病毒的病原调查及S基因的遗传进化分析. 贾开文,操义恒,胡亚辉,党士荣,钟发钢,赵文娟,吴桐忠,韩猛立,张星星,张倩,周霞,黄新. 2024

[2]上海地区猪萨佩罗病毒的检测及遗传进化分析. 李本强,刘惠莉,刘佳佳,陶洁,程靖华,石迎,乔长涛,沈晓晖. 2023

[3]新疆和田地区鹅细小病毒感染调查及VP1基因遗传进化分析. 肖海侠,马万鹏,王燕,马雪连,米晓云,刘黎,苏战强. 2024

[4]我国牛副流感病毒3型山东分离株的研究. 朱远茂,蔡红,董秀梅,吕闯,史鸿飞,严昊,马磊,王姝,王雪枝,薛飞. 2013

[5]犊牛腹泻的病因、诊断及综合防治. 孙英峰,王英珍,丁伯良,任卫科. 2008

[6]牛诺如病毒及牛嵴病毒双重PCR检测方法的建立及初步应用. 师志海,徐照学,兰亚莉,王文佳. 2020

[7]牛诺如病毒和冠状病毒双重PCR检测方法的建立及初步应用. 王文佳,师志海,兰亚莉,徐照学. 2019

[8]犊牛腹泻致病原因及规模化牛场的程序化处理. 赵俊亮,吴建勇,翁业斌,葛建军,王登峰,马光辉. 2018

[9]黄白双花口服液治疗犊牛腹泻的系统药理学分析. 董书伟,樊灵芝,李磊,王海峰,朱海鲸,翟军军,屈雷,王胜义. 2021

[10]牛星状病毒EvaGreen实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用. 师志海,王文佳,张彬,孟红丽,王亚州,金磊,兰亚莉,徐照学. 2021

[11]犊牛病原性腹泻流行情况及综合防控研究概述. 钱英红,张兴夫,赵俊利,吉鹏华,赵景娣,吕猷,杨燕燕. 2021

[12]固原黄牛养殖现状及常见病症分析和处理措施. 张顺进,杨雪瑶,丁晓婷,蔡翠翠,黄永震,谢建亮,张国坪,万鹏. 2020

[13]犊牛腹泻的病因、临床症状及防治措施. 简志银,刘镜,夏林. 2020

[14]牛诺如病毒、牛星状病毒和牛环曲病毒多重PCR检测方法的建立及应用. 师志海,徐照学,兰亚莉,张彬,孟红丽,王亚州,金磊,王文佳. 2020

[15]规模化奶牛场犊牛腹泻病因与防治. 陈龙宾,王丽学,韩静,范寰,刘景喜. 2020

[16]常见犊牛腹泻病原的检测要点和防控措施. 于化福,靳文仲,刘景喜,芦娜,陈龙宾. 2020

[17]牛诺如病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用. 师志海,王文佳,兰亚莉,张彬,孟红丽,王亚州,滑留帅,徐照学. 2020

[18]牛星状病毒及牛环曲病毒双重RT-PCR检测方法的建立及初步应用. 王文佳,邓廷贤,赵丽,师志海. 2020

[19]内蒙古部分地区致犊牛腹泻产肠毒素大肠杆菌的调查研究. 钱英红,贾燕,谢梦圆,李文豪,刘平平,尚和卫,徐晓静. 2023

[20]基于网络药理学探讨葛根芩连汤治疗犊牛腹泻的作用机制. 贾燕,钱英红,曹金山,刘博,徐晓静,张双翼,毛伟. 2022

作者其他论文 更多>>

微信小程序