鸡传染性支气管炎病毒国内分离株D971mRNA_3和mRNA_4cDNA的分子特征

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘玉芬

作者： 刘玉芬;刘胜旺;荣骏弓;孔宪刚;刘宝全

作者机构：

关键词： 传染性支气管炎病毒

期刊名称： 中国兽医学报

ISSN： 1005-4545

年卷期： 2004 年 24 卷 2 期

页码： 122-125

收录情况： CSCD

摘要： 参照已发表的鸡传染性支气管炎病毒(infectlous bronchItis virus，IBV)基因序列，设计合成了1对引物，经RT- PCR扩增得到了IBV国内分离株D97l约1．3 kb的片段，其中包含3a、3b、E及M蛋白基因的完整0RF，并将该片段进行了克隆和序列测定。与国内外部分IBV毒株序列比较表明：D97l 3a基因与cU-T2、D1466、DE072、M41、GA／99和UK／66的3a基因核苷酸序列同源性在83％～89％之间，氨基酸序列同源性为77％～91％，其中与CU-T2毒株的同源性最低(分别为83％和77％)；3b基因与上述毒株的对应核苷酸序列同源性在85％～95％之间，氨基酸序列同源性为72％～96％，与CU-T2的同源性最高(分别为95％和96％)；E蛋白基因与CU-T2、Dl 466、DE072、M41、Ark99、 H52、Gray、GA／99和UK／66的核苷酸序列同源性在8l％～86％之间，氨基酸序列同源性为74％～80％。不同毒株推导的E蛋白C末端表现不同特征，其中D97lE蛋白C末端比CU～T2的对应区多9个氨基酸残基，而比本试验选用的其他参考毒株的相应区域短5～7个氨基酸残基。M基因与cU～T2、DE072、Gray、M41、H]20、H52、sD／97／02、LX4及 D4l的M基因核苷酸序列同源性在86％～91％之间，氨基酸序列同源性为85％～95％，其中与SD／97／02的同源性最高(分别为9l％和95％)。对M蛋白的3个功能区进行序列比较发现，其N端第1～19位与SD／97／02的同源性最高，达90％，与cU-T2的同源性为80％，而与其他毒株同源性均低于6l％；N端第20～1()()位含有3个跨膜疏水区， D971与其他参考毒株比较，该部位第20～67位相对保守，其中与sI)／97／()2的同源性为Ioo％，与其他毒株的同源性在97％以下；在推测的与核表壳连接的c端，D97l与sD／97／02在第10l～182位同源性为100％，与疫苗株H52和 H120及国内分离株Lx4和D4l的同源性为97％，而与本试验所选的国外参考毒株同源性在96％以下；在C端第184～219位D971与H52的同源性为100％，与H120和sI)／97／02的同源性为97％，与其他毒株的同源性也在96％以下，而且在C末端第220～222及224位与上述国内外参考毒株均不同，国内外各毒株在该4个位点氨基酸为丙氨酸、苏氨酸、甘氨酸和丝氨酸，而D971M蛋白的该区域氨基酸突变为丝氨酸、丙氨酸、缬氨酸和甘氨酸，该突变是否与 D971的生物学特性尤其是组织嗜性的变化相关还有待于进一步研究。以上结果表明，D97l与sD／97／02亲缘关系较其他毒株为近，但其遗传衍化又与国内使用的疫苗株H52和H120具有一定的联系。从其mRNA。和mRNA4 cDNA的序列分析来看，D971又具有独特的分子特征。

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