50份黄瓜核心种质的SSR标记筛选与聚类分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 金庆敏

作者： 金庆敏;林毓娥;吴廷全;钟玉娟;王瑞

作者机构：

关键词： 黄瓜;核心种质;SSR标记;多态性分析;聚类分析;遗传多样性

期刊名称： 广东农业科学

ISSN：

年卷期： 2023 年 009 期

页码： 39-48

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】分析50份来自全国各地的黄瓜核心种质资源的遗传多样性，为黄瓜育种提供依据和参考。【方法】对50份黄瓜核心种质资源的重要外观农艺性状进行统计，并利用全基因组设计66对SSR引物对其进行分子标记筛选及遗传多样性聚类分析。【结果】供试50份黄瓜核心种质材料的瓜皮颜色、刺瘤、瓜皮斑纹具有多样性。66对引物中有32对引物能够在不同黄瓜种质间扩增出清晰而稳定的多态性标记，这32对SSR引物共扩增出280个等位基因片段，其中多态性片段216个、占片段总数的77.1%，表明本研究筛选出的32对SSR引物遗传多态性较高，适用于黄瓜种质材料的遗传多样性分析。聚类结果与所调查的种质资源性状表现结果较为一致。50份黄瓜核心种质遗传相似系数最低为0.62、最高达1.00。在遗传相似系数0.754处，50份黄瓜种质材料聚为7类，即9份华南型材料聚为6类：Ⅰ类、Ⅲ类、Ⅳ类、Ⅴ类、Ⅵ类、Ⅶ类，其中Ⅳ类包含1份中间材料与9号华南型材料；40份华北型黄瓜材料聚为1类：Ⅱ类。表明华北型黄瓜材料和华南型黄瓜材料间相似系数低、亲缘关系远；华北型黄瓜材料间相似系数高、亲缘关系近、遗传背景窄、遗传多样性差；而华南型黄瓜材料间相似系数较低、亲缘关系较远、遗传背景宽、遗传多样性丰富。【结论】筛选出32对SSR引物可有效对50份黄瓜核心种质材料进行聚类分析，遗传相似系数为0.754处50份黄瓜材料聚为7类，其结果与性状调查结果相吻合；华北型黄瓜遗传背景窄、遗传多样性差，华南型黄瓜遗传背景相对较宽，遗传多样性丰富。

分类号： S642.2

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