吉富罗非鱼肠道微生物群落初步研究

文献类型: 中文期刊

第一作者: 朱昊俊

作者: 朱昊俊;强俊;陶易凡;包景文;陈德举;徐跑

作者机构:

关键词: 吉富罗非鱼(Oreochromis niloticus);肠道菌群;高通量测序技术;多样性

期刊名称: 淡水渔业

ISSN: 1000-6907

年卷期: 2020 年 50 卷 005 期

页码: 88-93

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为研究人工饲养条件下吉富罗非鱼(Oreochromis niloticus)肠道微生物多样性及其群落结构组成.采用16S rDNA测序技术对罗非鱼肠道前段(IC1段)与后段(IC2段)微生物种群进行分析.结果 显示:测序共计获得有效序列118490条,聚类为793个OTUs(Operational taxonomic units).在门水平上拟杆菌门(Bacteroidetes)、梭杆菌门(Fusobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、厚壁菌门(Firmicutes)和放线菌门(Ac-tinobacteria)六个门是优势菌门,占相对丰度的95%以上.差异分析表明,门水平上,IC1段和IC2段梭杆菌门和放线菌门相对丰度存在显著差异;属水平上,仅鲸杆菌属(Cetobacterium)存在显著差异.同时在多样性方面,IC1段的多样性要显著大于IC2段.结果 表明吉富罗非鱼肠道不同分段菌群优势菌群的种类相对一致,但是相对丰度存在差异.

分类号: S965.125

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