西方蜜蜂工蜂不同虫态发育的转录组学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 宋文菲
作者: 宋文菲;胡宗文;苗春辉;余玉生;杨爽;李亚辉
作者机构:
关键词: 西方蜜蜂;工蜂;生长发育;差异表达基因;信号通路;转录组测序
期刊名称: 南方农业学报
ISSN: 2095-1191
年卷期: 2022 年 003 期
页码: 748-758
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】基于转录组学对西方蜜蜂工蜂不同虫态间的差异表达基因(DEGs)进行筛选和功能注释分析,揭示与工蜂生长发育相关的信号通路,为深入解析工蜂生长发育的分子调控机理提供基础数据。【方法】以西方蜜蜂工蜂的3日龄幼虫、1日龄蛹和1日龄羽化工蜂3个虫态为研究对象,利用llumina NovaSeq 6000平台进行转录组测序,采用DESeq2筛选不同虫态样品间的表达差异基因,然后分别进行GO功能注释分析及KEGG信号通路富集分析,并通过实时荧光定量PCR进行验证。【结果】经转录组测序,在西方蜜蜂工蜂3日龄幼虫与1日龄蛹间筛选出4823个差异表达基因(51.86%上调,48.14%下调),在1日龄蛹与1日龄羽化工蜂间筛选出3295个差异表达基因(57.51%上调,42.49%下调),在3日龄幼虫与1日龄羽化工蜂间筛选出5267个差异表达基因(52.95%上调,47.05%下调)。GO功能注释分析结果显示,3日龄幼虫与1日龄蛹间的差异表达基因注释到43个GO功能条目,1日龄蛹与1日龄羽化工蜂间的差异表达基因注释到45个GO功能条目,3日龄幼虫与1日龄羽化工蜂间的差异表达基因注释到44个GO功能条目,主要涉及细胞过程、细胞部分及结合等。KEGG信号通路富集分析发现,3日龄幼虫与1日龄蛹间有2905个差异表达基因富集到332条KEGG信号通路上,其中17条KEGG信号通路呈显著富集,涉及核糖体、氧化磷酸化和昆虫激素生物合成等;1日龄蛹与1日龄羽化工蜂间有1644个差异表达基因富集到331条KEGG信号通路上,其中45条KEGG信号通路呈显著富集,涉及氧化磷酸化、生热作用和胰岛素分泌等;3日龄幼虫与1日龄羽化工蜂间有2958个差异表达基因富集到337条KEGG信号通路上,其中14条KEGG信号通路呈显著富集,涉及核糖体、蛋白酶体和胰岛素分泌等。6个随机挑选差异表达基因的实时荧光定量PCR检测结果与转录组测序结果相符,即转录组测序结果可靠。【结论】昆虫激素生物合成通路相关差异表达基因调控与西方蜜蜂工蜂各虫态JH滴度变化规律一致,氧化磷酸化信号通路则与各虫态的营养摄入和活动行为相关,而胰岛素分泌通路涉及各虫态的营养调控、脂肪体合成及细胞凋亡。可见,昆虫激素生物合成、胰岛素分泌和氧化磷酸化3种信号通路在西方蜜蜂工蜂幼虫、蛹和成虫的发育调控中发挥着重要作用。
分类号: S891
- 相关文献
[1]基于转录组测序筛选鸡皮肤毛囊性状相关基因和关键通路. 陈春,魏岳,黄聪,黎观红,谢金防,武艳平. 2023
[2]红望天眼金鱼皮肤变色机制的转录组学分析. 李荣妮,王赛赛,田仲,孙砚胜,张博,张欣. 2022
[3]雏鸡红细胞免疫相关基因差异表达的时序性研究. 贾悦,李月健,喻进,张晨亮,李娜娜,卢晓晓,张宁,李欣,张鼎,郝卫芳,马海利,高文伟,赵宇军,高诗敏,李建慧,李桂兰,闫芳,韩凌霞,宁官保,田文霞. 2015
[4]双孢蘑菇6个菌株不同发育阶段的转录组分析. 施肖堃,卢园萍,蔡志欣,郭仲杰,陈美元,廖剑华. 2019
[5]基于转录组学的不同色系蝴蝶兰花色苷差异积累分析. 张加强,史小华,刘慧春,马广莹,邹清成,朱开元,周江华,毛军铭. 2018
[6]基于RNA-Seq筛选ALV-J感染汶上芦花鸡肝差异表达致病相关基因. 张会永,吴井生,杨剑波,俞燕,薛倩,殷建玫,朱云芬,朱静,苏一军,李国辉,韩威. 2020
[7]鸭胚胎发育中后期胸肌发育阻滞的RNA-seq分析. 刘宏祥,徐文娟,朱春红,陶志云,宋卫涛,章双杰,李慧芳. 2018
[8]基于瘤胃转录组探究双峰驼沙漠适应性分子机制. 方艳,周俊文,关伟军,蒋琳,浦亚斌,赵倩君,何晓红,马月辉. 2021
[9]利用RNA-Seq技术分析草鱼生长性状相关基因和SNP标记. 孙雪,李胜杰,姜鹏,杜金星,周家辉,白俊杰. 2021
[10]芝麻根系响应铝胁迫的比较转录组分析. 梁俊超,赵云燕,颜小文,颜廷献,王郅琪,孙建,饶月亮,周红英,乐美旺. 2023
[11]鸭胚胎发育中后期胸肌发育阻滞的RNA-seq分析. 刘宏祥,徐文娟,朱春红,陶志云,宋卫涛,章双杰,李慧芳. 2018
[12]基于转录组测序技术挖掘大豆蛋白质合成相关基因. 郭静文,史晓蕾,刘茜,赵青松,邸锐,刘兵强,闫龙,王凤敏,张孟臣,赵宝华,杨春燕. 2019
[13]哈茨木霉Th-33厚垣孢子形成过程的转录组变化分析. 李梅,张林,庞莉,孙青,蒋细良. 2015
[14]转录组测序技术筛选安徽乌菜与普通白菜的差异表达基因. 王明霞,田红梅,江海坤,贾利,王艳,方凌. 2018
[15]不同磷酸盐浓度下浮游虫黄藻的转录组比较分析. 李月,王云龙,欧阳珑玲. 2022
[16]长日照条件下2个热带玉米自交系的转录组差异分析. 高媛,王小利,涂亮,刘鹏飞,郭向阳,王安贵,祝云芳,吴迅,陈泽辉. 2022
[17]野生稻基因导入系W6023对白叶枯菌的抗谱及转录组差异表达基因分析. 张明伟,徐飞飞,郝巍,王春连,赵开军. 2017
[18]桃响应葡萄座腔菌侵染的转录组学分析. 刘勇,王富荣,王会良,艾小艳,朱炜,孙中海,吕亮,龚林忠,何华平. 2024
[19]转录组测序技术在猪繁殖与呼吸综合征病毒研究中的应用. 梁婉,周丹娜,彭忠,杨克礼,段正赢,郭锐,刘威,吴斌,陈文杰,孟丽,田永祥. 2019
[20]转录组测序技术筛选安徽乌菜与普通白菜的差异表达基因. 王明霞,田红梅,江海坤,贾利,王艳,方凌. 2018
作者其他论文 更多>>
-
纺梭负蝗过冷却能力和低温存活率研究
作者:李文博;HAIDER BASHIR NAWAZ;王自杰;唐佳威;杨爽;陈欢欢;田睿林
关键词:纺梭负蝗;过冷却能力;低温;存活率
-
梨果实代谢组学研究进展
作者:李文远;林梦桦;李亚辉;于全琦;梁颖;张志勇
关键词:梨;代谢物;代谢组学;多组学
-
基于气相色谱-离子迁移谱分析不同产地秋月梨品质差异
作者:何婉琳;施露;林梦桦;李亚辉;梁颖;张志勇
关键词:秋月梨;气相色谱-离子迁移谱;挥发性香气成分;产地;指纹图谱
-
H2O2改性香蕉秆生物炭的结构变化及对玉米幼苗Cr吸收的影响
作者:宋书会;杨爽;王超;李普旺;焦静;刘思汝;何祖宇;刘运浩;周闯;杨子明
关键词:过氧化氢(H2O2);生物炭;铬(Cr);玉米;生长
-
大蜡螟性肽受体基因GmelSPR克隆及表达分析
作者:朱雅楠;赵必安;张洋逸;李雨时;梁铖;宗德琴;杨爽
关键词:大蜡螟;性肽受体基因;GmelSPR;基因克隆;表达谱
-
滇南西蜂定地饲养双王群的组织及优势研究
作者:余玉生
关键词:滇南西蜂;双王群,饲养管理
-
西方蜜蜂Sirtuin蛋白家族基因鉴定及表达分析
作者:宋文菲;刘娜;苗春辉;余玉生;胡宗文;王艳辉;李亚辉
关键词:Sirtuin蛋白;西方蜜蜂;生物信息学;基因组;系统发育;表达模式