甘蓝NLR家族全基因组鉴定、进化分析及在不同病害胁迫下的表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 邢苗苗

作者： 邢苗苗;刘星;孔枞枞;杨丽梅;庄木;张扬勇;王勇;方智远;吕红豪

作者机构：

关键词： 甘蓝;NLR家族基因;抗病;表达分析

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2019 年 04 期

页码： 723-737

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 从全基因组水平鉴定了87个甘蓝NLR基因家族成员,并对其进行了进化分析和表达分析。基因结构和motif组成分析表明,87个基因可分为5个亚类:NB-LRR(34个)、CC-NB-LRR(6个)、TIR-NB-LRR(45个)、RPW8-NB-LRR(1个)和CC-TIR-NB-LRR(1个);染色体定位分析表明,该家族基因在9条染色体上呈不均匀地单一或成簇分布;进化分析表明,甘蓝35个NLR基因与白菜NLR基因存在同源关系,其余52个基因为甘蓝特有;利用转录组数据分析了参与甘蓝枯萎病、黑腐病、根肿病、霜霉病、白粉病等抗性应答相关的差异表达基因,发现参与不同病害胁迫抗性应答反应的NLR基因差异较大,这可能与不同NLR基因对不同病原特异性识别有关。

分类号： S635

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