长雄野生稻地下茎cDNA文库的构建及EST分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 林海妹

作者: 林海妹;郭安平;王晓玲;郭运玲;孔华;贺立卡

作者机构:

关键词: 长雄野生稻;地下茎;cDNA文库

期刊名称: 热带作物学报

ISSN: 1000-2561

年卷期: 2009 年 30 卷 05 期

页码: 123-127

收录情况: CSCD

摘要: 长雄野生稻(Oryza longisatminata)是广泛生长在热带非洲的1个野生种,具有明显的地下茎特征。为了探索控制其地下茎发育的相关基因及其他优异基因,初步构建了地下茎cDNA文库。文库指标显示:初始滴度为2.5×105cfu/μg,扩增滴度为2.9×108cfu/μg,库容为5×106cfu,重组率为82%;随机挑选80个单克隆进行测序,插入片段在400~1000bp之间;对测序结果进行比对分析,获得了58个已报道有一定功能的EST序列,22个未见报道的EST序列;并利用PAUP4.0软件对序列进行了筛选分析。

分类号: S511.9

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