谷子SiCDPK9基因的克隆、亚细胞定位与盐胁迫下表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 崔燕娇
作者: 崔燕娇;刘丹;李素英;张静;刘正理
作者机构:
关键词: 谷子;杂种优势;钙依赖蛋白激酶;生物信息学分析;亚细胞定位
期刊名称: 江苏农业科学
ISSN: 1002-1302
年卷期: 2025 年 53 卷 004 期
页码: 178-185
收录情况: 北大核心
摘要: 杂种优势是指杂交子1代(F1)在生物量、产量、适应性、抗逆性等性状上优于双亲的现象,其广泛使用使得玉米、高粱、水稻等作物产量实现大幅提升。近年来,谷子杂交种选育工作也取得较大进展,但关于杂种优势形成的分子机制和调控网络的研究尚不多见。SiCDPK9是前期通过转录组数据分析获得的谷子产量性状杂种优势相关基因,为阐明其功能及其参与产量性状杂种优势形成的作用机制,本研究以谷子强优势杂交种56229的幼穗为材料,克隆SiCDPK9基因,采用生物信息学方法分析其序列特征,并进行亚细胞定位分析,同时,利用实时荧光定量PCR技术检测其在盐胁迫处理下的表达模式。结果表明,SiCDPK9基因的开放阅读框长度为1 749 bp,编码582个氨基酸,具有典型的丝/苏氨酸蛋白激酶催化结构域和EF-hand类钙离子结合结构域;SiCDPK9为不稳定的亲水性蛋白,分子质量为64.40 ku,理论等电点为9.08;SiCDPK9蛋白具有48个磷酸化位点和2个棕榈酰化修饰位点,不含信号肽序列;SiCDPK9蛋白结构以α螺旋和无规则卷曲为主,定位于细胞膜;通过氨基酸序列比对与系统进化分析发现,SiCDPK9与水稻小穗育性相关基因OsCPK9的氨基酸序列相似性高、亲缘关系近;外源NaCl处理后,SiCDPK9的表达水平先升后降。以上结果暗示SiCDPK9基因可能通过响应逆境胁迫而参与对谷子产量性状杂种优势形成的调控。
分类号: S515
- 相关文献
[1]陆地棉耐碱基因GHZAT12的克隆、表达及生物信息学分析. 范亚朋,范亚朋,芮存,张悦新,陈修贵,陆许可,王帅,张红,徐楠,王晶,陈超,叶武威. 2021
[2]高羊茅FaGST1基因克隆、亚细胞定位及表达分析. 陈锡,赵德刚,陈莹,吴佳海,袁暘暘,王小利. 2020
[3]绣球花铝转运蛋白HmALMT11的生物信息学及其表达特性分析. 王晓玥,陈双双,齐香玉,冯景,陈慧杰,孙明,邓衍明. 2024
[4]猪精子发生候选基因PYGO2的分离、表达和亚细胞定位研究. 赵筱,张霞,范俐,杨忠,霍金龙,曾日彬,刘丽仙,霍海龙. 2021
[5]柑橘黄化脉明病毒的TGB基因生物信息学分析及亚细胞定位. 崔甜甜,王艳娇,李中安,周常勇,宋震. 2017
[6]萝卜开花基因RsFLC3的克隆与表达分析. 谭萍,罗小波,李亚东,彭潇,裴芸,杨光乾,金月月,祖贵东,田欢,张万萍. 2024
[7]小麦TaGPX8基因的克隆与表达分析. 张华东,李雅倩,董飞燕,丁芳草,刘孟伟,许嘉盛,高春保,王晓玲,刘易科,方正武. 2023
[8]不同辣椒AT3(酰基转移酶3)基因的克隆表达与生物信息学分析. 吴媛,苏世贤,常媚瑕,汪淘,龙茶,韦金江,江苏燕,蓬桂华,何磊,袁远国,李伟. 2024
[9]荔枝LcAsr基因的生物信息学分析与载体构建. 董凤英,王家保,徐碧玉,金志强. 2009
[10]小麦矮腥黑粉菌g9890基因编码效应蛋白的生物信息学分析及亚细胞定位. 许停,刘太国,高利,陈万权. 2023
[11]小麦矮腥黑粉菌效应蛋白g11335的生物信息学分析、亚细胞定位及毒性验证. 郭志浩,金泽鑫,刘琦,高利. 2022
[12]辣椒胶孢炭疽菌CFEM效应因子鉴定及转录组分析. 刘思珍,欧阳超,满益龙,盛家伟,陈岳,张鑫,郑立敏,李智强,李大伟,张德咏,刘勇,王运生,谭新球. 2021
[13]山羊干扰素刺激基因15克隆、生物信息学分析及亚细胞定位. 唐井玉,杜汉宇,孟春春,刘光清. 2022
[14]马铃薯StSTOP1基因的克隆、亚细胞定位及基因家族成员鉴定. 黄美菁,吕春娜,康嘉慧,周一帆,赵酏浛,王芳. 2025
[15]小麦矮腥黑粉菌g6843蛋白生物信息学分析、毒性验证及亚细胞定位. 贾玉凤,张滨,郭笑维,马骏豪,刘琦,高利. 2025
[16]小麦光腥黑粉菌效应蛋白g2164的生物信息学分析、亚细胞定位及毒性验证. 常璐,方正武,高利. 2025
[17]百合LoAPS1克隆及其在休眠解除过程的功能分析. 徐小萍,杨成龙,和兴,郭文杰,吴健,方少忠. 2025
[18]谷子F-box家族基因的鉴定、分类及干旱响应. 霍冬英,郑炜君,李盼松,徐兆师,周永斌,陈明,马有志,闵东红,张小红. 2014
[19]谷子WRKY36转录因子的分子特性及功能鉴定. 祖倩丽,尹丽娟,徐兆师,陈明,周永斌,李连城,马有志,闵东红,张小红. 2015
[20]谷子SBP转录因子家族基因的表达分析. 杜晓芬,韩康妮,李禹欣,王智兰,连世超,王军. 2021
作者其他论文 更多>>
-
随机分布条件下种群空斑对点格局分析结果的影响
作者:李聿泽;王鑫厅;李海兵;范静宇;姜超;刘芳;李素英;梁存柱
关键词:空斑;点格局分析;K(r)函数;g(r)函数;屏蔽
-
高产抗病两系杂交水稻新品种E两优2300
作者:王红波;殷得所;薛莲;金卫兵;胡鹏;董华林;吴波;段洪波;郑兴飞;胡建林;罗肖陨;刘丹;徐得泽
关键词:两系杂交水稻;E两优2300;新品种;高产;抗稻瘟病;抗倒伏
-
乙蒜素与氨基寡糖素对甜瓜细菌性果斑病协同杀菌作用研究
作者:付欣;张媛媛;朱发娣;张静;郭永霞;冯岗
关键词:乙蒜素;氨基寡糖素;甜瓜;协同增效
-
联合净化法结合高效液相色谱-串联质谱同时测定鸽蛋中5类24种兽药残留
作者:张静;马丽娜;刘茵茵;周倩;唐修君;陆俊贤;樊艳凤;赵敏;高玉时
关键词:联合净化法;高效液相色谱-串联质谱;QuEChERS;兽药残留;鸽蛋
-
皖江平原冬闲田油菜扩种空间潜力及影响因子研究
作者:陈实;黄银兰;陈家芳;刘丹;杨梦婷;陈亦辉;张驰;邹金秋
关键词:冬闲田;冬油菜;MaxEnt模型;空间潜力;皖江平原
-
基于深度学习的羊肚菌菌丝生长程度识别模型算法研究
作者:朱丹;张静;李季;海云瑞;周慧
关键词:深度学习;图像识别;羊肚菌菌丝;识别模型
-
生态清洁小流域案例研究
作者:赵旭珍;张静
关键词:生态清洁小流域;水土保持;面源污染治理;生态修复;可持续发展
