1株新型鹅星状病毒的全基因序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 赵瑞宏
作者: 赵瑞宏;胡晓苗;侯宏艳;周学利;潘孝成;戴银
作者机构:
关键词: 新型鹅星状病毒;全基因;序列分析;组织分布
期刊名称: 安徽农业科学
ISSN: 0517-6611
年卷期: 2024 年 016 期
页码: 87-90
摘要: 为研究新型鹅星状病毒(Novel goose astroviruses, N-GAstV)的遗传进化特征,获得了鹅星状病毒安徽分离株AstV/AHHX的全长基因,为7 251 nt。测序分析显示:AstV/AHHX具有典型的新型鹅星状病毒基因组特征。AstV/AHHX与分离株GDZJ37以及山东分离株G538和G576的遗传距离较近;同时与毒株GDZJ37、G538和G576的ORF2氨基酸序列同源性达100%,ORF1a和ORF1b的同源性也有99.6%以上,推测它们由同一毒株演化而来。ORF2氨基酸序列位点分析显示有12高变异位点,分别是第36(Y/S/H)、60(V/I)、224(T/A)、228(A/S/T)、229(P/Q)、289(T/A)、376(T/A)、456(D/E)、540(Q/L)、608(S/T)、610(E/D/G)、614(N/A/T)位氨基酸。其中第224、228、229、608、614位的氨基酸突变可能导致病毒蛋白质的构象及功能发生变化,进而改变病毒的致病能力。
分类号: S852.65
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