禽腺病毒血清4型感染LMH细胞的环状RNA表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 殷冬冬

作者： 殷冬冬;朱梦琪;兰梦蝶;朱星星;尹磊;沈学怀;王洁茹;赵瑞宏;戴银;潘孝成

作者机构：

关键词： 禽腺病毒血清4型;LMH细胞;转录组测序;环状RNA;差异表达

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2025 年 40 卷 004 期

页码： 219-224

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为分析禽腺病毒血清4 型(FAdV-4)感染鸡肝癌细胞(LMH)后环状RNA(circRNA)的表达谱变化,进一步研究circRNA在FAdV-4 感染过程中的调控作用,以FAdV-4 感染的LMH和未感染细胞为对象进行转录组测序,对差异表达circRNA进行GO功能和KEGG信号通路富集分析,通过实时荧光定量 PCR(qRT-PCR)对随机挑选的5 个circRNA进行验证.结果表明,感染组和未感染组的circRNA分布于绝大多数染色体上,且长度主要集中在300~1 000 bp.差异表达分析筛选出72 个circRNA,32 个circRNA表达水平显著上调,40 个circRNA表达水平下调.GO功能分析,差异circRNA来源基因主要富集在细胞过程、代谢过程、催化活性和核酸结合转录因子活性等进程.KEGG通路分析显示,差异表达circRNA主要富集在Notch信号通路、RNA降解和MAPK信号通路.qRT-PCR结果表明,被验证的 5 个circRNA表达水平与测序结果趋势一致,进一步验证了测序结果的可靠性.本研究对FAdV-4 感染LMH细胞的cir-cRNA表达谱进行分析,并筛选出差异表达的circRNA,为探究circRNA在FAdV-4 感染过程中的功能及宿主与FAdV-4 互作机制提供数据支持.

分类号： S852.65

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