辣椒Ty3-gypsy逆转录转座子逆转录酶序列的克隆及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李宁

作者： 李宁;杨生保;杨涛;王柏柯;唐亚萍;王强;帕提古丽·艾斯木托拉;余庆辉

作者机构：

关键词： 辣椒;Ty3-gypsy逆转录转座子;逆转录酶

期刊名称： 新疆农业科学

ISSN： 1001-4330

年卷期： 2016 年 53 卷 12 期

页码： 2166-2174

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】从辣椒基因组中克隆Ty3-gypsy逆转录转座子逆转录酶序列,分析其家族特性及进化关系。【方法】根据Ty3-gypsy逆转录转座子逆转录酶保守区域设计简并引物,通过PCR扩增、回收、克隆、测序得到的目的基因序列。【结果】克隆从辣椒基因组14条逆转录转座子逆转录酶序列,序列大小均为340 bp左右。生物信息学分析表明,序列长度变化范围为310~345 bp,同源性范围为60.2%~99.1%。这些核苷酸序列具有较高的异质性,主要表现为终止密码子突变。聚类分析可将所得序列分为5大类,基于逆转录酶序列进行的不同物种进化树分析显示,第Ⅳ、Ⅴ类序列与荸荠、潘那利番茄等组成一大类,可能是逆转录转座子横向传递的结果。【结论】辣椒Ty3-gypsy逆转录转座子逆转录酶序列具有普遍性、异质性等特点,与荸荠、潘那利番茄等物种的同类型逆转座子可能有相同的起源。

分类号： S641.3

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