罗非鱼性别相关微卫星标记的初步筛选
文献类型: 中文期刊
第一作者: 陈文伟
作者: 陈文伟;曹建萌;刘志刚;杨娜;卢迈新
作者机构:
关键词: 尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus);奥利亚罗非鱼(O.aureus);微卫星;性别;遗传多样性
期刊名称: 淡水渔业
ISSN: 1000-6907
年卷期: 2020 年 01 期
页码: 22-30
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要:
为分析罗非鱼群体的遗传多样性以及筛选与罗非鱼性别相关的微卫星标记。应用24对微卫星引物,使用常规PCR及聚丙烯酰胺凝胶电泳的方法在两个尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)群体和两个奥利亚罗非鱼(O.aureus)群体中初步筛选到UNH931、GM128、GM201、GM258、GM597以及UNH898共6个与性别相关的微卫星标记。然后使用降落PCR以及毛细管电泳的方法在两个尼罗罗非鱼群体、两个奥利亚罗非鱼群体以及ZY_1、WY_1、YY_1和YY_2型罗非鱼群体中进一步扩增这6个微卫星标记,统计各群体的遗传多样性参数:6个微卫星标记在上述群体共297个样本中检测到95个等位基因,其大小在97~302 bp之间,各位点在各群体等位基因数在1~13个之间,各群体平均观测等位基因数为2.167~9.333,平均有效等位基因数为1.624~4.966,平均观测杂合度为0.324~0.983,平均期望杂合度为0.329~0.782,平均多态信息含量为0.275~0.753;两个尼罗罗非鱼群体、WY_1和YY_2群体达到高度多态(PIC>0.5),两个奥利亚罗非鱼群体、ZY_1和YY_1群体为中度多态(0.25
分类号:
S917.4
- 相关文献
[1]四种罗非鱼精子超微结构的比较. 张涛,邹桂伟,梁宏伟,李忠. 2015
[2]微卫星标记对4个贵州地方牛品种遗传多样性研究. 杨红文,韩勇,刘镜,肖礼华,粟朝芝. 2016
[3]舟山近海棘头梅童鱼群体遗传多样性微卫星DNA分析. 林能锋,苏永全,丁少雄,王军. 2011
[4]优质细毛羊遗传多样性的微卫星分析. 刘桂芬,张恩平,田可川,黄锡霞,张亚妮. 2004
[5]大菱鲆4个引进地理群体遗传多样性的微卫星分析. 侯仕营,马爱军,王新安,黄智慧,薛宝贵,杨志,曲江波. 2011
[6]利用微卫星分析家禽的遗传多样性. 韩雪,粟朝芝,朱丽莉,顾永芬,陶宇航. 2015
[7]4个贵州乌骨鸡群体遗传关系的微卫星标记分析. 伍革民,张继,唐继高. 2018
[8]贵州5个地方猪品种微卫星标记的遗传多样性. 陈祥,丁玫,许厚强,尚以顺,胡家炘,龙威海,冯文武. 2015
[9]利用微卫星PCR分析普安乌骨鸡的遗传结构. 唐继高,朱丽莉,李洪曙,王清颖,韩雁雁. 2015
[10]太湖稻区及国内部分香稻SSR指纹图谱构建及遗传多样性初析. 朱勇良,谢裕林,黄凌哲,吴建祥,乔中英,王建平,黄萌,陈培峰. 2012
[11]微卫星技术分析东北虎遗传多样性及亲缘关系. 吴云良,包文斌,张红霞,郑维平,李文斌,徐琪,陈国宏. 2011
[12]绍兴鸭品系间的遗传结构分析. 宋雪花,孙菊英,吕钢进,麻丽坤,刘玮孟. 2010
[13]西北不同地理种群红色型豌豆蚜的遗传多样性. 金娟,王森山,贺春贵. 2013
[14]利用微卫星标记分析长顺绿壳蛋鸡的遗传多样性. 韩雪,粟朝芝,李亮,陶宇航. 2016
[15]杏遗传多样性评价所需SSR等位变异数目估计. 章秋平,刘威生,刘硕,魏潇,刘宁. 2015
[16]中国美利奴(新疆军垦型)羊遗传多样性的微卫星分析. 曾献存,石国庆,王建华,何启宏,张永胜,彭林泽,余智勇,贾斌. 2007
[17]4个虹鳟养殖品系的分子鉴定和遗传多样性分析. 徐浩,鲁翠云,郭薇,孙效文. 2013
[18]牙鲆5个养殖群体的遗传多样性分析. 刘海金,朱晓琛,孙效文,杨立更,薛玲玲,毛连菊. 2008
[19]微卫星标记在人工养殖小体鲟种群的数据分析方法比较和遗传多样性分析. 董颖,杨瑞,姜志强,胡红霞. 2016
[20]利用微卫星标记分析长鳍鲤、锦鲤和龙凤鲤的遗传多样性. 孙莉,杨国梁,王军毅,吴婷婷,张海波,吴添文,陈国宏. 2009
作者其他论文 更多>>
-
尼罗罗非鱼MYF6基因SNP位点筛选及其与生长性状的关联分析
作者:高风英;佟延南;刘志刚;曹建萌;王淼;衣萌萌;可小丽;卢迈新;朱海
关键词:尼罗罗非鱼;肌源性因子6(MYF6);SNP;双倍型;生长性状
-
eDNA监测空间分辨率量化方法研究-以长江中游干流平水期为案例
作者:杨海乐;许兰馨;周琼;刘志刚;吴金明
关键词:环境DNA监测;空间分辨率;可信度与覆盖度;流域生物信息流;流域生态学
-
离子色谱法测定水稻秸秆降解液中的氟离子和氯离子
作者:杨娜;易扬;孙小淋
关键词:离子色谱法;水稻秸秆降解液;阴离子
-
POU1F1基因SNP位点与尼罗罗非鱼体质量和形态性状的相关性
作者:高风英;佟延南;曹建萌;刘志刚;王淼;衣萌萌;可小丽;卢迈新;朱海
关键词:尼罗罗非鱼;POU1F1;SNPs;双倍型;体质量;形态性状
-
零价铁活化过硫酸盐降解土壤中邻苯二甲酸酯
作者:李海峰;刘河疆;郭文博;苏含明;刘志刚;马兴旺;刘国宏
关键词:零价铁;过硫酸盐;土壤;邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯;降解效率
-
罗非鱼混养对广西三江传统稻渔综合种养系统环境及其菌群多样性的影响
作者:王淼;莫洁琳;韦领英;莫航;杨世宇;衣萌萌;范梓健;张紫玥;卢迈新
关键词:稻渔综合种养系统;罗非鱼;鲤;水体;底泥;菌群;高通量测序
-
基于无人机多光谱NDVI值估测玉米产量
作者:张磊;姚梦瑶;刘志刚;李娟;杨洋;蔡大润;陈果;李波;李晓荣;陈勋基;翟云龙
关键词:玉米;产量;归一化植被指数(NDVI);偏最小二乘回归(PLSR)