羊传染性脓疱病毒感染山羊皮肤成纤维上皮细胞差异表达mi RN A分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张大俊

作者： 张大俊;侯景;申超超;徐国伟;孔汉金;成伟伟;郑海学;刘湘涛;张克山

作者机构：

关键词： 羊传染性脓疱病毒;山羊皮肤成纤维细胞;病毒感染;差异表达miRNA

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2020 年 51 卷 008 期

页码： 1932-1938

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在研究羊传染性脓疱病毒(orf virus,orfv)感染山羊皮肤成纤维细胞(goat skin fibroblasts cell,GSF)对GSF细胞microRNA(miRNA)表达谱影响,探究miRNA在orfv感染过程中的作用及调控机制.分别提取感染和未感染orfv的GSF细胞总RNA,构建miRNA文库,利用高通量测序技术进行miRNA差异表达分析,对差异表达miRNA靶基因进行预测,并进行GO和KEGG分析,随机选取10个差异miRNA进行RT-qPCR验证.结果显示,orfv感染组和未感染GSF细胞组相比共有678个显著差异表达的miRNA(fold change≥1.5),其中,上调表达miRNA有509个,下调表达miRNA有169个,uniq_miRNA的Venn图分析显示,感染组和对照组共有的miRNA仅占8.21%;GO和KEGG分析显示,差异表达miRNA主要参与脂质代谢、受体及细胞因子信号转导等细胞生物学过程,RT-qPCR验证结果与高通量测序结果一致.本研究结果表明,orfv感染GSF细胞对其编码的miRNA有显著影响,获得大量GSF细胞编码的与orfv感染相关的差异miRNA,为进一步从宿主miRNA层面揭示orfv感染和致病机制提供了参考依据.

分类号： S852.659.1

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