羊口疮病毒B2L蛋白二级结构及其细胞表位的预测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王光祥

作者： 王光祥;尚佑军;吕占禄;田宏;张克山;刘湘涛

作者机构：

关键词： 羊口疮病毒;B2L基因;二级结构;B细胞表位;T细胞表位;预测

期刊名称： 中国兽医科学

ISSN： 1673-4696

年卷期： 2012 年 11 期

页码： 1133-1138

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用网络平台的SOPMA服务器和DNAStar软件预测羊口疮病毒(ORFV)B2L蛋白的二级结构;综合利用DNAStar软件、二级结构预测及ABCpred方案预测羊口疮病毒B2L蛋白的B细胞表位;分别采用人工神经网络法(ANNA)和在线程序预测羊口疮病毒B2L蛋白的细胞毒性T细胞和辅助T细胞的抗原表位。结果显示,羊口疮病毒B2L蛋白的整个结构中α-螺旋区域和无规则卷曲区域出现得较多,其中α-螺旋占30.42%,β-片层占24.34%,β-转角占5.56%,无规则卷曲占39.68%;有6个优势B细胞表位,3个细胞毒性T细胞表位和2个辅助T细胞表位。本研究为ORFV诊断方法的建立、单克隆抗体的制备及表位疫苗的研制提供了理论依据。

分类号： S858.26

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