葡萄果粒形状简化基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张恒

作者： 张恒;刘众杰;樊秀彩;张川;崔力文;刘崇怀;房经贵

作者机构：

关键词： 葡萄;果粒形状;SLAF;基因组关联分析

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2017 年 44 卷 10 期

页码： 1959-1968

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了寻找控制葡萄果粒形状的基因位点,本研究中对304个葡萄种质的果形性状了进行简化基因组关联分析。对葡萄种质材料的基因组DNA进行测序,平均测序深度为8.13×,共开发466 618个SLAF标签,其中多态性SLAF标签有392 374个。比对测序分析获得了4 241 729个SNP标记,进一步根据完整度大于0.8以及次要基因型频率大于0.05的标准进行过滤,共得到481 192个SNP。本次检测到的控制葡萄果粒形状的相关位点为首次报道,除基于一般线性模型的SNP rs26137624外,其余检测表型遗传变异贡献率均大于11%。基于一般线性模型和混合线性模型分别关联到7个和3个显著性SNP标记,且均位于2号染色体上。通过筛选每个显著性SNP标记上下游区域,对关联区域进行功能基因挖掘,共得到10个有预测功能注释的基因和7个未知功能的基因。

分类号： S663.1

  • 相关文献

[1]葡萄种质资源果形性状的分析. 张培安,樊秀彩,刘众杰,吴伟民,刘崇怀,房经贵. 2018

[2]葡萄种质资源果实形状的鉴定评价. 张长运,王境杨,樊秀彩,张颖,姜建福,刘崇怀,孙磊. 2024

[3]蒺藜苜蓿、天蓝苜蓿、金花菜基因组SNP穿梭标记开发. 任海龙,魏臻武,陈祥. 2017

[4]苹果SLAF图谱构建及果锈基因QTL分析. 张朝红,陈东玫,杨凤秋,赵同生,李扬,赵国栋,赵永波. 2019

[5]基于SLAF-Super BSA技术的玉米萌发期耐冷性定位的初步研究. 曹士亮,于滔,董玲,刘宝民,王成波,李文跃,杨耿斌,武尔娜. 2021

[6]采用SLAF-seq技术开发甘蓝型油菜霜霉病抗性SNP位点. 王伟,刘凡,任莉,徐理,陈旺,曾令益,黄炳文,方小平. 2016

[7]控制高粱分蘖与主茎株高一致性的基因定位. 王瑞,凌亮,詹鹏杰,于纪珍,楚建强,平俊爱,张福耀. 2019

[8]甜樱桃高密度连锁图谱的构建. 王晶,闫国华,张晓明,周宇,张开春. 2014

[9]采用SLAF - seq技术开发甘蓝型油菜霜霉病抗性SNP位点. 王伟,刘凡,任莉,徐理,陈旺,曾令益,黄炳文,方小平. 2016

[10]2012/2013年度智利鲜食苹果、葡萄及梨产销概况. 董朝菊. 2012

[11]葡萄贮藏生理研究进展. 李桂芬,刘延松. 2000

[12]葡萄水平平行双母蔓Y型架栽培技术研究. 刘洪章,苗博英,欧阳寿如,赵宪争. 2004

[13]葡萄果实定位方法的实验研究. 贾艳婷,马本学,王运祥,杨杰,王静,周强. 2015

[14]葡萄新品种黎明无核及其丰产栽培技术. 王德生. 1997

[15]根域限制对葡萄果实发育和主要营养物质含量的影响. 谢兆森,李勃,许文平,王世平. 2008

[16]鲜食葡萄新品种-醉金香. 王德生. 1999

[17]干旱区葡萄节水栽培技术研究进展. 郭绍杰,陈恢彪,李铭,苏学德,吴鹏,李鹏程. 2012

[18]单氰胺对葡萄破眠效果研究. 杨仕品,钟霈霖,乔荣,杨跃虎. 2015

[19]高产优质葡萄新品种-红脸无核. 王德生. 1996

[20]天津地区葡萄产业现状及发展趋势. 李树海,黄健全,田淑芬,商佳胤,高扬,张娜. 2010

作者其他论文 更多>>

微信小程序