椰子织蛾转录组分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 徐志文
作者: 徐志文;任雪敏;王俊;张枝全;刘乃勇;阎伟;朱家颖
作者机构:
关键词: 椰子织蛾;转录组;基因;功能注释
期刊名称: 西南林业大学学报(自然科学)
ISSN: 2095-1914
年卷期: 2018 年 05 期
页码: 38-45
收录情况: 北大核心
摘要: 为获取入侵性检疫害虫椰子织蛾的基因信息,利用高通量测序技术对该害虫进行了转录组测序。结果表明:经拼接共获得了37 416条unigenes,平均长度为803 bp,N50为1 415 bp;通过BlastX比对,有19 154条unigenes (51.19%)成功在Nr中被注释。在Nr中成功注释的unigene,与黑脉金斑蝶同源性最高,达到68.45%;在GO注释中,共有14 131 (37.76%)条unigenes被成功注释到细胞组分、分子功能和生物过程3大类的54个分支;在COG数据库中,成功注释的8 606条unigenes被注释到26个分类;在KEGG中,共有6 171条(16.49%) unigenes被注释到5大类通路的260条途径上。基于构建的转录组数据库,鉴定得到3 248个微卫星。
分类号: S763.42
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