椰子织蛾转录组分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 徐志文
作者: 徐志文;任雪敏;王俊;张枝全;刘乃勇;阎伟;朱家颖
作者机构:
关键词: 椰子织蛾;转录组;基因;功能注释
期刊名称: 西南林业大学学报(自然科学)
ISSN: 2095-1914
年卷期: 2018 年 05 期
页码: 38-45
收录情况: 北大核心
摘要: 为获取入侵性检疫害虫椰子织蛾的基因信息,利用高通量测序技术对该害虫进行了转录组测序。结果表明:经拼接共获得了37 416条unigenes,平均长度为803 bp,N50为1 415 bp;通过BlastX比对,有19 154条unigenes (51.19%)成功在Nr中被注释。在Nr中成功注释的unigene,与黑脉金斑蝶同源性最高,达到68.45%;在GO注释中,共有14 131 (37.76%)条unigenes被成功注释到细胞组分、分子功能和生物过程3大类的54个分支;在COG数据库中,成功注释的8 606条unigenes被注释到26个分类;在KEGG中,共有6 171条(16.49%) unigenes被注释到5大类通路的260条途径上。基于构建的转录组数据库,鉴定得到3 248个微卫星。
分类号: S763.42
- 相关文献
[1]基于RNA-Seq的辣木叶转录组研究. 张雅玲,王小安,潘少霖,叶新福. 2017
[2]青梗花椰菜和白梗花椰菜转录组分析. 林珲,薛珠政,李永平,李大忠,刘建汀,朱海生,温庆放. 2018
[3]基于转录组测序的紫色秋葵花青素合成相关基因研究. 张少平,应璐,邱珊莲,张帅,洪建基,郑开斌,余文权. 2018
[4]溪黄草转录组测序及生物信息学分析. 王继华,蔡时可,梅瑜,李汉章,杨少海. 2020
[5]8个番石榴品种的转录组测序. 张丽梅,陈钟佃,张朝坤,魏秀清,许家辉. 2021
[6]基于转录组测序的铁皮石斛黄酮代谢途径及相关基因解析. 林江波,王伟英,邹晖,戴艺民. 2019
[7]张溪香芋转录组测序及生物信息学分析. 王继华,罗群胜,梅瑜,杨少海. 2020
[8]芒果果实转录组数据组装及基因功能注释. 武红霞,许文天,罗纯,姚全胜,王松标,马小卫,詹儒林. 2016
[9]中泰南五味子转录组测序及生物信息学分析. 李静宇,徐友阳,蔡时可,王继华. 2022
[10]黄秋葵花和果荚转录组测序及类黄酮代谢差异表达分析. 姚运法,张少平,练冬梅,赖正锋,黄慧明,洪建基. 2018
[11]金毛狗转录组测序及生物信息学分析. 蔡时可,梅瑜,陈炜玲,史广生,李静宇,王继华. 2022
[12]紫背天葵高通量转录组测序分析. 张少平,洪建基,邱珊莲,郑云云,张帅,吴松海,何炎森,郑开斌,郑加协. 2016
[13]鸟巢蕨转录组高通量测序及分析. 贾新平,孙晓波,邓衍明,梁丽建,叶晓青. 2014
[14]显齿蛇葡萄转录组测序、注释与分析. 徐友阳,王德勤,李静宇,梅瑜,王继华,蔡时可. 2022
[15]基于高通量测序的建兰转录组信息分析. 樊荣辉,林兵,吴建设,钟淮钦. 2023
[16]独脚金转录组特征分析. 张龙,蔡时可,孙金锴,梅瑜,王继华. 2023
[17]松萝凤梨转录组测序分析. 金亮,田丹青,詹书侠,安霞,葛亚英,王炜勇. 2019
[18]柚芽变株系类胡萝卜素代谢差异基因的转录组学分析. 潘鹤立,潘腾飞,佘文琴,徐世荣,李小婷,黄汉唐,陈源,吴少华,潘东明. 2020
[19]利用转录组测序分析茄子萼片刺相关差异基因. 潜宗伟,陈海丽,崔彦玲. 2019
[20]菠萝蜜响应低温胁迫的转录组分析. 杜英俊,朱鹏锦,钟云婕,唐秀观,何江,宋奇琦,欧景莉,叶维雁. 2023
作者其他论文 更多>>
-
野生花鲈幼鱼对人工鱼礁模型的趋集性研究
作者:张贝叶;左涛;张传涛;曹金凤;王俊
关键词:花鲈;人工鱼礁;分布率;趋集行为
-
大豆巢式关联作图(NAM)群体构建及花色和种皮色遗传分析
作者:宋健;熊亚俊;陈伊洁;徐瑞新;刘康林;郭庆元;洪慧龙;高华伟;谷勇哲;张丽娟;郭勇;阎哲;刘章雄;关荣霞;李英慧;王晓波;郭兵福;孙如建;闫龙;王好让;姬月梅;常汝镇;王俊;邱丽娟
关键词:大豆;NAM群体;花色;种皮色;遗传分析
-
健康和物理损伤条件下椰树叶柄挥发物组分比较分析
作者:刘博;阎伟;刘丽
关键词:椰子树;气相色谱-质谱联用技术;植物挥发物;叶柄;物理损伤
-
湖北省农业科技成果转化现状与对策
作者:王俊;黄咏明;汪梦莹;黄立清;姚明华;刘友梅
关键词:湖北省;农业科技成果转化;资金投入;企业培育;人才队伍建设
-
我国东亚江豚的研究现状、面临的威胁与保护建议
作者:程兆龙;李永涛;左涛;牛明香;王俊
关键词:海洋生物学;东亚江豚;研究现状;威胁;保护
-
黄河口西南侧小岛河河口天然牡蛎礁的牡蛎种群结构
作者:左涛;张贝叶;王俊;左明;王安东
关键词:近江牡蛎;长牡蛎;种群结构;牡蛎礁;黄河口
-
日粮酵母硒添加水平对北京油鸡生产性能、蛋品质、蛋硒含量和抗氧化能力的影响
作者:齐志国;金银姬;闻治国;付瑶;王俊;程柏丛;吴迪梅;郭江鹏
关键词:北京油鸡;酵母硒;蛋品质;蛋硒含量