Race法扩增4株鸭肝炎病毒3′末端序列及其克隆分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 邵泽香

作者： 邵泽香;韦强;崔言顺;鲍国连;刘燕;季权安

作者机构：

关键词： 3′RACE;鸭病毒性肝炎病毒;序列比对分析;3′端非编码区;Poly(A)

期刊名称： 浙江农业学报

ISSN： 1004-1524

年卷期： 2009 年 21 卷 03 期

页码： 225-229

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用3′RACE方法扩增并克隆了4株鸭肝炎病毒(DHV)(ZYM株、Z05株、Z07株和Z10株)的基因组的3′末端真实序列,包括部分非结构蛋白(3D)基因以及紧接着3D基因下游的3′端非编码区(untranslated region,UTR)和poly(A)尾巴。测序结果表明,扩增的特异性片段长度为597 nt(不包括polyA尾巴)。各毒株3′UTR均为315 nt,位于终止密码子TGA之后,比对分析结果表明各毒株间的同源性较高;4株DHV 3′末端核苷酸序列(不包括polyA尾巴)之间的同源性为96.3%~100%,而与参考毒株之间的同源性为93.5%~99.7%。在系统发生进化树上,各毒株亲缘关系较近。

分类号： S852.65

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