辣椒PIN基因家族鉴定及其在果柄离区和根系发育中的表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 何磊

作者： 何磊;严希;赖卫;刘崇政;杨红;何建文

作者机构：

关键词： 辣椒;果柄;PIN基因家族;生物信息学;表达分析

期刊名称： 西北植物学报

ISSN： 1000-4025

年卷期： 2024 年 44 卷 012 期

页码： 1878-1889

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】鉴定和分析辣椒PIN基因家族成员的特征及其在果柄离区和根系发育中的表达情况，为解析CaPINs功能及辣椒新品种培育提供候选基因。【方法】通过辣椒全基因组筛选鉴定PIN基因，并开展生物信息学分析，对这些基因在果柄离区和根系发育中进行表达分析。【结果】在辣椒基因组中鉴定出9个PIN基因家族成员，命名为CaPIN1-CaPIN9,分布于7条染色体上，CaPIN9未锚定。CaPINs蛋白的氨基酸数为358～654 aa,分子质量为39 251.05～71 170.91 D,等电点为6.40～9.38,且多数成员为稳定蛋白。CaPINs成员间具有明显的共线性，与番茄具有较近的遗传关系。CaPINs基因包含大量生长、环境及激素响应元件。转录组数据分析表明辣椒CaPINs的表达具有组织特异性。荧光定量PCR结果显示，CaPINs在不同果柄离区和根系发育中有不同程度表达。【结论】辣椒CaPINs特异性参与果柄离区形成与根系生长发育，可作为辣椒易脱柄品种培育和根系遗传改良的重要候选基因。

分类号： S641.3

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