辣椒C2H2型锌指蛋白家族基因鉴定及其在涝胁迫下的表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王楠艺

作者： 王楠艺;范高领;付文婷;吴迪;杨娅;黄冬福;王立浩;吴康云;何建文

作者机构：

关键词： 辣椒;C2H2型锌指蛋白;涝胁迫;生物信息学

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2025 年 41 卷 001 期

页码： 134-149

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了探究辣椒C2H2型锌指蛋白家族在响应涝胁迫中的作用，本研究通过生物信息学方法对辣椒C2H2型锌指蛋白家族蛋白理化性质、基因结构、染色体定位、顺式作用元件进行了全面分析。结果表明，辣椒C2H2型锌指蛋白家族包含91个成员，多数成员定位于细胞核。91个成员可被分为6个亚族，不同亚族的成员基因结构存在差异。C2H2型锌指蛋白家族基因启动子区域主要包含植物生长发育元件、植物激素响应元件及逆境胁迫响应元件。对耐涝辣椒资源GC41和涝胁迫敏感型辣椒资源GC39在涝胁迫下的转录组数据进行分析，结果表明，在GC41中，CaC2H2-17、CaC2H2-87在涝胁迫处理3 d时相对表达量高，CaC2H2-17、CaC2H2-87在GC39中未表达。筛选出CaC2H2-16（Capana01g003556）、CaC2H2-32（Capana04g001616）、CaC2H2-72（Capana11g000176）、 CaC2H2-73（Capana11g000178）、CaC2H2-87（Capana12g000773）5个转录因子，这5个转录因子分别调控了419个、526个、566个、305个、480个差异表达基因。本研究结果为辣椒C2H2家族成员的功能解析及耐涝辣椒资源的分子育种提供了重要的理论依据和数据支持。

分类号： S641.3

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