PCV2海南株全基因组的克隆与序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 曹宗喜

作者： 曹宗喜;郑心力;张艳;叶保国;林哲敏;王峰

作者机构：

关键词： 猪圆环病毒2型;全基因组;克隆;序列分析

期刊名称： 广东农业科学

ISSN： 1004-874X

年卷期： 2015 年 42 卷 08 期

页码： 118-123

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究猪圆环病毒2型(PCV2)海南株的分子特征,采用PCR方法从疑似PCV2感染的猪组织病料中扩增基因并进行序列分析。结果表明:8株PCV2海南株均属于PCV2b型,其中7株为PCV2b-1C亚型,1株为PCV2b-1A/1B亚型。PCV2海南株的ORF2基因的长度均为705 bp,编码234个氨基酸。Cap蛋白的抗原表位区发生了一定的变异。8个PCV2海南株的ORF2基因之间核苷酸序列相似性及推导的氨基酸序列相似性分别为95.3%~99.7%和93.6%~100%。海南株与国内分离株(AY682994,AF381175,JX945577,JX682407,AY180397)的核苷酸序列相似性为91.0%~99.9%,推导的氨基酸相似性为91.0%~99.6%。海南株与国外分离株(NC_005148,JQ994268,KJ187306,AF201307,AF454546,AY754020)的核苷酸序列相似性为90.0%~97.0%,推导的氨基酸相似性为88.0%~97.9%。海南株与疫苗株SH的核苷酸序列相似性为98.2%~100.0%,推导的氨基酸相似性为94.9%~100.0%。海南株与疫苗株LG的核苷酸序列相似性为90.6%~91.7%,推导的氨基酸相似性为89.7%~91.0%。这些数据为海南地区PCV2的防控和疫苗株选择提供了理论依据。

分类号： S852.65

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