黄瓜果实发育相关基因CsIAA29的克隆与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 于越

作者： 于越;陈海燕;周龙;郭冬雪;宫思宇;郝宁;杜亚琳;武涛

作者机构：

关键词： 黄瓜;果实发育;表达分析;CsIAA29

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2020 年 35 卷 0z1 期

页码： 11-17

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 前期通过EMS诱变方法获得黄瓜短果突变体,并对其进行了转录组分析,获得了一个在短果突变体中上调表达的差异表达基因CsIAA29(Csa2G381840),log2FC=2.09.该基因属于Aux/IAA家族基因,参与植物生长发育早期生长素应答过程.为了研究CsIAA29基因在黄瓜生长发育期的作用,采用PCR技术从黄瓜649中克隆CsIAA29基因的CDS序列.利用Expasy等在线软件对CsIAA29进行蛋白质理化分析,结果表明,CsIAA29蛋白质编码207个氨基酸,分子式为C1062 H1634 N302 O313 S7,脂肪系数为71.16,总平均亲水性为-0.831.蛋白质结构域预测发现,CsIAA29有4个结构域,符合Aux/IAA家族的结构域特征,初步估计4个结构域的功能应该和Aux/IAA家族Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ是一致的.进化分析表明,黄瓜CsIAA29与南瓜和甜瓜中的IAA29亲缘关系较近.qRT-PCR分析结果表明,CsIAA29基因在黄瓜子房表达量最高,而在雄花、叶片中的表达量相对较低.利用PLANTCAT在线软件对CsIAA29基因启动子元件进行分析,结果表明,CsIAA29基因的启动子包含了多个与调节植物内源生长激素运输相关的调控元件,推测其可能参与黄瓜生长素极性运输等生物途径.上述试验结果证明,CsIAA29基因可能通过调控果实内源生长激素等途径影响黄瓜果实生长发育.

分类号： S642.2%X172

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